44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0755 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0755  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  793    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0752  hypothetical protein  94.19 
 
 		 327 aa  640    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0085  citrate lyase beta subunit-like protein  61.18 
 
 		 345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0806  hypothetical protein  43.59 
 
 		 316 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0938  hypothetical protein  44.05 
 
 		 316 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0275  citrate lyase beta subunit-like  43.46 
 
 		 316 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1345  ATP/GTP-binding protein  41.27 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0657  hypothetical protein  41.61 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0671404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3794  hypothetical protein  41.61 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.569922  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3882  hypothetical protein  41.29 
 
 		 319 aa  223  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1006  ATP/GTP-binding protein  37.39 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.949119  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3689  hypothetical protein  42.17 
 
 		 317 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4662  ATP/GTP-binding protein  38.91 
 
 		 315 aa  206  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0898  ATP/GTP-binding protein  35.62 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0143  ATP/GTP-binding protein  29.46 
 
 		 367 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5097  ATP/GTP-binding protein  28.91 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5091  hypothetical protein  28.57 
 
 		 367 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3189  hypothetical protein  28.49 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33920  citrate lyase beta subunit  26.99 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3013  hypothetical protein  28.61 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000857475  decreased coverage  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0579  hypothetical protein  27.69 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0340  putative ATP/GTP-binding protein  26.89 
 
 		 381 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3307  putative citrate lyase beta subunit  28.13 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22999  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4761  hypothetical protein  28.21 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1062  putative ATP/GTP-binding protein  26.92 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3670  citrate lyase beta subunit-like  26.24 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.568716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  24.92 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  29.71 
 
 		 292 aa  53.1  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  29.71 
 
 		 292 aa  53.1  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.71 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.71 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.71 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.71 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  24.07 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  33.75 
 
 		 274 aa  47  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  29.21 
 
 		 303 aa  46.6  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2184  HpcH/HpaI aldolase  24.14 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00433365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  37.5 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  30.11 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  26.81 
 
 		 294 aa  44.3  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  22.04 
 
 		 280 aa  43.9  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  21.71 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  27.87 
 
 		 293 aa  42.7  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  21.48 
 
 		 296 aa  42.7  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>