42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0938 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0938  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0806  hypothetical protein  96.2 
 
 		 316 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0275  citrate lyase beta subunit-like  75.24 
 
 		 316 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3882  hypothetical protein  51.3 
 
 		 319 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1345  ATP/GTP-binding protein  51.85 
 
 		 318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0657  hypothetical protein  50.97 
 
 		 319 aa  288  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0671404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3794  hypothetical protein  50.97 
 
 		 319 aa  288  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.569922  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3689  hypothetical protein  55.18 
 
 		 317 aa  286  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0755  hypothetical protein  44.05 
 
 		 380 aa  249  6e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0752  hypothetical protein  43.85 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0085  citrate lyase beta subunit-like protein  42.55 
 
 		 345 aa  243  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0898  ATP/GTP-binding protein  44.07 
 
 		 309 aa  228  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4662  ATP/GTP-binding protein  42.9 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1006  ATP/GTP-binding protein  43.1 
 
 		 325 aa  216  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.949119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5091  hypothetical protein  31.6 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33920  citrate lyase beta subunit  32.85 
 
 		 385 aa  132  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5097  ATP/GTP-binding protein  30.67 
 
 		 367 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0143  ATP/GTP-binding protein  31.17 
 
 		 367 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3189  hypothetical protein  32.45 
 
 		 385 aa  123  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0579  hypothetical protein  30.97 
 
 		 392 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0340  putative ATP/GTP-binding protein  32.16 
 
 		 381 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3013  hypothetical protein  32.87 
 
 		 387 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000857475  decreased coverage  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4761  hypothetical protein  30.92 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1062  putative ATP/GTP-binding protein  31.2 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3670  citrate lyase beta subunit-like  30.86 
 
 		 417 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.568716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3307  putative citrate lyase beta subunit  30.43 
 
 		 405 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22999  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  27.69 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  25.11 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  26.04 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  24.74 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  28.82 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  23.51 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  26.36 
 
 		 282 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  23.78 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  26.59 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  26.17 
 
 		 284 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  23.75 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  27.17 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  24.81 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  24.18 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  29.75 
 
 		 293 aa  42.7  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  27.74 
 
 		 285 aa  42.4  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>