32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0275 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0275  citrate lyase beta subunit-like  100 
 
 
316 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0938  hypothetical protein  75.24 
 
 
316 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0806  hypothetical protein  73.95 
 
 
316 aa  474  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0657  hypothetical protein  50.5 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0671404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3794  hypothetical protein  50.5 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.569922  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3882  hypothetical protein  50.17 
 
 
319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3689  hypothetical protein  51.99 
 
 
317 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1345  ATP/GTP-binding protein  49.21 
 
 
318 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0085  citrate lyase beta subunit-like protein  42.86 
 
 
345 aa  248  7e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0752  hypothetical protein  43.91 
 
 
327 aa  247  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0755  hypothetical protein  43.46 
 
 
380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0898  ATP/GTP-binding protein  43.13 
 
 
309 aa  235  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4662  ATP/GTP-binding protein  42.62 
 
 
315 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1006  ATP/GTP-binding protein  41.38 
 
 
325 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.949119  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33920  citrate lyase beta subunit  32.54 
 
 
385 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3013  hypothetical protein  32.17 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000857475  decreased coverage  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3189  hypothetical protein  31.45 
 
 
385 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5091  hypothetical protein  30.7 
 
 
367 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0340  putative ATP/GTP-binding protein  31.18 
 
 
381 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5097  ATP/GTP-binding protein  29.56 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0579  hypothetical protein  30.23 
 
 
392 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0143  ATP/GTP-binding protein  29.56 
 
 
367 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4761  hypothetical protein  29.45 
 
 
389 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1062  putative ATP/GTP-binding protein  30.35 
 
 
397 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3670  citrate lyase beta subunit-like  30.26 
 
 
417 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.568716  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3307  putative citrate lyase beta subunit  31.49 
 
 
405 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22999  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  25.56 
 
 
296 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.549232 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  25.51 
 
 
269 aa  46.2  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  29.2 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  24.44 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  24.44 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  28.2 
 
 
290 aa  42.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>