42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0806 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0806  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0938  hypothetical protein  96.2 
 
 		 316 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0275  citrate lyase beta subunit-like  73.95 
 
 		 316 aa  474  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1345  ATP/GTP-binding protein  51.52 
 
 		 318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3689  hypothetical protein  53.33 
 
 		 317 aa  285  9e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3882  hypothetical protein  51.52 
 
 		 319 aa  285  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0657  hypothetical protein  51.18 
 
 		 319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0671404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3794  hypothetical protein  51.18 
 
 		 319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.569922  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0755  hypothetical protein  43.59 
 
 		 380 aa  249  5e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0752  hypothetical protein  42.9 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0085  citrate lyase beta subunit-like protein  42.72 
 
 		 345 aa  245  8e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0898  ATP/GTP-binding protein  42.72 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4662  ATP/GTP-binding protein  42.76 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1006  ATP/GTP-binding protein  41.86 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.949119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5091  hypothetical protein  30.67 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33920  citrate lyase beta subunit  32.56 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5097  ATP/GTP-binding protein  30.25 
 
 		 367 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0143  ATP/GTP-binding protein  30.25 
 
 		 367 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3013  hypothetical protein  33.33 
 
 		 387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000857475  decreased coverage  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0340  putative ATP/GTP-binding protein  31.98 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0579  hypothetical protein  30.59 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4761  hypothetical protein  31.21 
 
 		 389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3189  hypothetical protein  32.15 
 
 		 385 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1062  putative ATP/GTP-binding protein  30.92 
 
 		 397 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3670  citrate lyase beta subunit-like  30.75 
 
 		 417 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.568716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3307  putative citrate lyase beta subunit  30.41 
 
 		 405 aa  97.1  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22999  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  24.43 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  27.69 
 
 		 277 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  24.74 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  25 
 
 		 284 aa  50.1  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  24.81 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  27.36 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  25.19 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  24.83 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  26.3 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  25.19 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  24.63 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1535  Citryl-CoA lyase  26.01 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  23.78 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  25.2 
 
 		 284 aa  43.5  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  27.16 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  25 
 
 		 285 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>