32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3689 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3689  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  652    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1345  ATP/GTP-binding protein  71.7 
 
 		 318 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3882  hypothetical protein  67 
 
 		 319 aa  428  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0657  hypothetical protein  67.33 
 
 		 319 aa  428  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0671404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3794  hypothetical protein  67.33 
 
 		 319 aa  428  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.569922  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0938  hypothetical protein  55.18 
 
 		 316 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0806  hypothetical protein  54.15 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0275  citrate lyase beta subunit-like  52.65 
 
 		 316 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0085  citrate lyase beta subunit-like protein  42.73 
 
 		 345 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0752  hypothetical protein  41.82 
 
 		 327 aa  232  7.000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0755  hypothetical protein  42.17 
 
 		 380 aa  230  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4662  ATP/GTP-binding protein  42.47 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1006  ATP/GTP-binding protein  42.81 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.949119  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0898  ATP/GTP-binding protein  41.37 
 
 		 309 aa  219  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33920  citrate lyase beta subunit  32.75 
 
 		 385 aa  136  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0579  hypothetical protein  30.99 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5097  ATP/GTP-binding protein  30.31 
 
 		 367 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0143  ATP/GTP-binding protein  29.57 
 
 		 367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4761  hypothetical protein  31.7 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3189  hypothetical protein  31.88 
 
 		 385 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5091  hypothetical protein  28.35 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0340  putative ATP/GTP-binding protein  30.48 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3013  hypothetical protein  31.91 
 
 		 387 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000857475  decreased coverage  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1062  putative ATP/GTP-binding protein  30.03 
 
 		 397 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3307  putative citrate lyase beta subunit  30.57 
 
 		 405 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22999  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3670  citrate lyase beta subunit-like  28.93 
 
 		 417 aa  105  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.568716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  27.96 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  27.15 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  27.15 
 
 		 292 aa  47  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  31.43 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  33.72 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  31.91 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>