30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1345 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1345  ATP/GTP-binding protein  100 
 
 		 318 aa  656    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3689  hypothetical protein  71.7 
 
 		 317 aa  471  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3882  hypothetical protein  66.13 
 
 		 319 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0657  hypothetical protein  66.45 
 
 		 319 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0671404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3794  hypothetical protein  66.45 
 
 		 319 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.569922  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0938  hypothetical protein  51.85 
 
 		 316 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0806  hypothetical protein  51.52 
 
 		 316 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0275  citrate lyase beta subunit-like  49.21 
 
 		 316 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0085  citrate lyase beta subunit-like protein  42.2 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0755  hypothetical protein  41.27 
 
 		 380 aa  236  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0752  hypothetical protein  40.31 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4662  ATP/GTP-binding protein  42.37 
 
 		 315 aa  225  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0898  ATP/GTP-binding protein  43.14 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1006  ATP/GTP-binding protein  42.09 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.949119  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33920  citrate lyase beta subunit  31.69 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5097  ATP/GTP-binding protein  30.59 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0143  ATP/GTP-binding protein  30.38 
 
 		 367 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0340  putative ATP/GTP-binding protein  31.37 
 
 		 381 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5091  hypothetical protein  30.29 
 
 		 367 aa  135  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0579  hypothetical protein  32.95 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4761  hypothetical protein  31.32 
 
 		 389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3013  hypothetical protein  31.21 
 
 		 387 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000857475  decreased coverage  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1062  putative ATP/GTP-binding protein  29.72 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3307  putative citrate lyase beta subunit  30.68 
 
 		 405 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22999  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3670  citrate lyase beta subunit-like  28.37 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.568716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  22.7 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  24.91 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  22.9 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  27.49 
 
 		 282 aa  42.4  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>