27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3307 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3307  putative citrate lyase beta subunit  100 
 
 		 405 aa  802    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22999  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3189  hypothetical protein  52.58 
 
 		 385 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33920  citrate lyase beta subunit  51.41 
 
 		 385 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3670  citrate lyase beta subunit-like  49.14 
 
 		 417 aa  332  6e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.568716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1062  putative ATP/GTP-binding protein  48.14 
 
 		 397 aa  327  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4761  hypothetical protein  48.2 
 
 		 389 aa  325  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3013  hypothetical protein  45.94 
 
 		 387 aa  312  5.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000857475  decreased coverage  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0579  hypothetical protein  39.03 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0340  putative ATP/GTP-binding protein  41.64 
 
 		 381 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0143  ATP/GTP-binding protein  34.53 
 
 		 367 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5097  ATP/GTP-binding protein  34.27 
 
 		 367 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5091  hypothetical protein  34.95 
 
 		 367 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1345  ATP/GTP-binding protein  30.68 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1006  ATP/GTP-binding protein  29.23 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.949119  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3882  hypothetical protein  30.9 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3794  hypothetical protein  30.62 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.569922  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0657  hypothetical protein  30.62 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0671404 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3689  hypothetical protein  30.57 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0755  hypothetical protein  28.13 
 
 		 380 aa  109  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0085  citrate lyase beta subunit-like protein  27.84 
 
 		 345 aa  106  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4662  ATP/GTP-binding protein  30.62 
 
 		 315 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0752  hypothetical protein  28.37 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0938  hypothetical protein  30.43 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0806  hypothetical protein  30.41 
 
 		 316 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0275  citrate lyase beta subunit-like  31.49 
 
 		 316 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0898  ATP/GTP-binding protein  30.06 
 
 		 309 aa  90.5  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  34.07 
 
 		 290 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>