32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0657 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3882  hypothetical protein  99.69 
 
 
319 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0657  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  663    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0671404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3794  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  663    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.569922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1345  ATP/GTP-binding protein  66.45 
 
 
318 aa  432  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3689  hypothetical protein  67.33 
 
 
317 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0938  hypothetical protein  50.97 
 
 
316 aa  288  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0275  citrate lyase beta subunit-like  50.5 
 
 
316 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0806  hypothetical protein  51.18 
 
 
316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0085  citrate lyase beta subunit-like protein  41.05 
 
 
345 aa  235  9e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4662  ATP/GTP-binding protein  42.18 
 
 
315 aa  231  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0752  hypothetical protein  41.59 
 
 
327 aa  224  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0755  hypothetical protein  41.61 
 
 
380 aa  223  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1006  ATP/GTP-binding protein  40.67 
 
 
325 aa  212  7e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.949119  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0898  ATP/GTP-binding protein  40.73 
 
 
309 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33920  citrate lyase beta subunit  32.37 
 
 
385 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0579  hypothetical protein  31.69 
 
 
392 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5097  ATP/GTP-binding protein  30.84 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5091  hypothetical protein  31.09 
 
 
367 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0143  ATP/GTP-binding protein  30.33 
 
 
367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0340  putative ATP/GTP-binding protein  31.01 
 
 
381 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3189  hypothetical protein  32.18 
 
 
385 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3013  hypothetical protein  33.24 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000857475  decreased coverage  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4761  hypothetical protein  30.99 
 
 
389 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1062  putative ATP/GTP-binding protein  29.26 
 
 
397 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3307  putative citrate lyase beta subunit  30.62 
 
 
405 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22999  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3670  citrate lyase beta subunit-like  27.27 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.568716  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  31.4 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  31.93 
 
 
292 aa  47.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  28.29 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  23.91 
 
 
281 aa  42.7  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  22.63 
 
 
285 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  27.46 
 
 
293 aa  42.4  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>