62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1006 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1006  ATP/GTP-binding protein  100 
 
 		 325 aa  662    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.949119  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4662  ATP/GTP-binding protein  44.76 
 
 		 315 aa  249  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0898  ATP/GTP-binding protein  45.99 
 
 		 309 aa  249  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0085  citrate lyase beta subunit-like protein  39.88 
 
 		 345 aa  228  9e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1345  ATP/GTP-binding protein  42.09 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0755  hypothetical protein  37.39 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0806  hypothetical protein  41.86 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0938  hypothetical protein  43.1 
 
 		 316 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3689  hypothetical protein  42.47 
 
 		 317 aa  215  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0752  hypothetical protein  37.93 
 
 		 327 aa  212  7e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0657  hypothetical protein  40.67 
 
 		 319 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0671404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3794  hypothetical protein  40.67 
 
 		 319 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.569922  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3882  hypothetical protein  40.33 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0275  citrate lyase beta subunit-like  41.38 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3189  hypothetical protein  32.66 
 
 		 385 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0579  hypothetical protein  32.56 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0340  putative ATP/GTP-binding protein  31.61 
 
 		 381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5091  hypothetical protein  31.69 
 
 		 367 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5097  ATP/GTP-binding protein  31.38 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3013  hypothetical protein  30.14 
 
 		 387 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000857475  decreased coverage  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0143  ATP/GTP-binding protein  31.38 
 
 		 367 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33920  citrate lyase beta subunit  29.8 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1062  putative ATP/GTP-binding protein  29.46 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3307  putative citrate lyase beta subunit  29.23 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22999  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3670  citrate lyase beta subunit-like  30.03 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.568716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4761  hypothetical protein  25.36 
 
 		 389 aa  97.4  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  28.48 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  28.92 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  28.57 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  24.1 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  24.1 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  24.1 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  24.1 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  31.36 
 
 		 282 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  28.57 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  23.58 
 
 		 277 aa  49.3  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  29.55 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  29.55 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  27.34 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  22.99 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  24.28 
 
 		 276 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  23.88 
 
 		 274 aa  46.6  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  27.66 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  27.66 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  27.66 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  27.66 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  25.64 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  29.55 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  23.1 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  24.54 
 
 		 271 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  28.12 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5821  HpcH/HpaI aldolase  25.35 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.577572  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  25.37 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  23.08 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  25.37 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  22.57 
 
 		 285 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  24.25 
 
 		 276 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  26.67 
 
 		 293 aa  42.7  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  33.04 
 
 		 291 aa  42.7  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  26.47 
 
 		 292 aa  42.7  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  26.47 
 
 		 292 aa  42.7  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  22.52 
 
 		 308 aa  42.4  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>