26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33920 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33920  citrate lyase beta subunit  100 
 
 		 385 aa  787    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3189  hypothetical protein  58.7 
 
 		 385 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1062  putative ATP/GTP-binding protein  52.28 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4761  hypothetical protein  50.92 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3307  putative citrate lyase beta subunit  51.41 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22999  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3013  hypothetical protein  50.65 
 
 		 387 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000857475  decreased coverage  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3670  citrate lyase beta subunit-like  52.03 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.568716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0579  hypothetical protein  42.82 
 
 		 392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0340  putative ATP/GTP-binding protein  45.5 
 
 		 381 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5091  hypothetical protein  42.01 
 
 		 367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0143  ATP/GTP-binding protein  41.49 
 
 		 367 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5097  ATP/GTP-binding protein  41.49 
 
 		 367 aa  311  9e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3794  hypothetical protein  32.37 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.569922  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3882  hypothetical protein  32.66 
 
 		 319 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0657  hypothetical protein  32.37 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0671404 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1345  ATP/GTP-binding protein  31.69 
 
 		 318 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0806  hypothetical protein  32.56 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3689  hypothetical protein  32.16 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0938  hypothetical protein  32.85 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0275  citrate lyase beta subunit-like  32.54 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1006  ATP/GTP-binding protein  29.8 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.949119  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0755  hypothetical protein  26.99 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0752  hypothetical protein  27.45 
 
 		 327 aa  113  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4662  ATP/GTP-binding protein  31.58 
 
 		 315 aa  113  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0085  citrate lyase beta subunit-like protein  28.1 
 
 		 345 aa  113  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0898  ATP/GTP-binding protein  29.33 
 
 		 309 aa  94  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>