More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5539 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5539  ABC transporter related  100 
 
 
256 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5261  ABC transporter related  93.75 
 
 
256 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36497  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4549  ABC transporter related  79.84 
 
 
255 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0968  ABC transporter related  72.66 
 
 
256 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  73.52 
 
 
265 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2778  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.31 
 
 
263 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2506  ABC transporter  70.92 
 
 
261 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0247071  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  58.3 
 
 
242 aa  280  2e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  55.87 
 
 
258 aa  277  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  57.66 
 
 
242 aa  277  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  56.63 
 
 
244 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  54.76 
 
 
262 aa  276  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  54.84 
 
 
252 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  56.18 
 
 
252 aa  275  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 
244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.44 
 
 
244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  56.28 
 
 
252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  54.47 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.04 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.04 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 
244 aa  272  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 
244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  53.04 
 
 
244 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 
244 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 
244 aa  271  6e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 
244 aa  271  7e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.04 
 
 
244 aa  270  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.25 
 
 
254 aa  270  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  55.46 
 
 
250 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  55.46 
 
 
254 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  55.04 
 
 
250 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  55.65 
 
 
244 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  53.85 
 
 
244 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  52.21 
 
 
254 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  54.84 
 
 
247 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  55.42 
 
 
267 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  53.6 
 
 
263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  52.8 
 
 
254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  52.78 
 
 
248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  54.8 
 
 
254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  55.02 
 
 
246 aa  268  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5811  ABC transporter related  52 
 
 
268 aa  268  8e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306389  normal  0.349168 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3310  ABC transporter related  54.44 
 
 
247 aa  268  8.999999999999999e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  54.77 
 
 
252 aa  268  8.999999999999999e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  52.44 
 
 
240 aa  267  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  53.63 
 
 
254 aa  267  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  53.6 
 
 
249 aa  267  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  53.17 
 
 
256 aa  267  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  53.66 
 
 
244 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  54.03 
 
 
243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  55.2 
 
 
263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  53.41 
 
 
263 aa  265  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  54.03 
 
 
248 aa  265  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.03 
 
 
248 aa  265  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  52.82 
 
 
289 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.47 
 
 
246 aa  265  8e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  53.2 
 
 
244 aa  264  8.999999999999999e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  55.42 
 
 
252 aa  264  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  54.58 
 
 
263 aa  264  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  53.25 
 
 
243 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  51.42 
 
 
242 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  53.23 
 
 
247 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  52.42 
 
 
289 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  53.66 
 
 
249 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  55.24 
 
 
254 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  52.19 
 
 
274 aa  263  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  53.25 
 
 
243 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  53.41 
 
 
245 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  52 
 
 
244 aa  262  4e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  52.85 
 
 
268 aa  262  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  54.12 
 
 
255 aa  262  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  52.8 
 
 
257 aa  262  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  53.2 
 
 
254 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.16 
 
 
268 aa  262  4.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  53.25 
 
 
249 aa  261  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  52.02 
 
 
288 aa  261  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  53.25 
 
 
249 aa  261  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  53.01 
 
 
252 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.83 
 
 
250 aa  261  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  53.85 
 
 
241 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  54 
 
 
241 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  50 
 
 
255 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  53.28 
 
 
256 aa  260  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  52.82 
 
 
247 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  51.98 
 
 
258 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  52.59 
 
 
246 aa  260  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  54.66 
 
 
246 aa  260  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1206  ABC transporter-like  53.66 
 
 
254 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  52.82 
 
 
254 aa  259  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  53.66 
 
 
249 aa  259  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  54.55 
 
 
247 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  53.04 
 
 
243 aa  260  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  54.4 
 
 
254 aa  259  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  53.56 
 
 
261 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  51.41 
 
 
256 aa  259  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  53.2 
 
 
256 aa  258  4e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5245  ABC transporter related  51.78 
 
 
261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0596713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1959  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51 
 
 
242 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131421  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  52.03 
 
 
248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  50.2 
 
 
256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>