More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4549 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4549  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0968  ABC transporter related  81.5 
 
 		 256 aa  440  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212738  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5261  ABC transporter related  79.84 
 
 		 256 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5539  ABC transporter related  79.84 
 
 		 256 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  73.31 
 
 		 265 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2778  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.52 
 
 		 263 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2506  ABC transporter  70.52 
 
 		 261 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0247071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.82 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  57.43 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  57.49 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  57.32 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  56.45 
 
 		 289 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  55.28 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  55.28 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  56.05 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  54.8 
 
 		 288 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  56.28 
 
 		 243 aa  275  6e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  55.24 
 
 		 249 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  54.07 
 
 		 240 aa  271  6e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  52.61 
 
 		 263 aa  271  6e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  54.62 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.88 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  53.57 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  54.25 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  55.65 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  52.82 
 
 		 275 aa  269  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0949  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.63 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  56.07 
 
 		 254 aa  268  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.63 
 
 		 244 aa  268  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  55.02 
 
 		 254 aa  268  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  56.28 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  56.9 
 
 		 250 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  53.04 
 
 		 244 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  56.49 
 
 		 250 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.23 
 
 		 244 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.23 
 
 		 244 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0755  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0689  ABC transporter-related protein  54.25 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  53.66 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.03 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.07 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0947  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.63 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0762  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  54.07 
 
 		 267 aa  266  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1037  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  54.58 
 
 		 263 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1711  ABC transporter related  52.99 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  54.47 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  51.98 
 
 		 265 aa  265  4e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  52.82 
 
 		 244 aa  265  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  53.63 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  54.13 
 
 		 261 aa  265  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.4 
 
 		 254 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1315  polar amino acid ABC transporter ATPase  57.08 
 
 		 250 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4428  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.42 
 
 		 244 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177089  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  54.44 
 
 		 244 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  53.85 
 
 		 252 aa  265  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  52.42 
 
 		 244 aa  265  7e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  54.29 
 
 		 254 aa  264  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  52.61 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  51.59 
 
 		 265 aa  263  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  53.44 
 
 		 257 aa  263  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  54.84 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  51.63 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  53.85 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  53.04 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  50.2 
 
 		 248 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  53.66 
 
 		 268 aa  263  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  52.44 
 
 		 239 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.99 
 
 		 268 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.82 
 
 		 244 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 		 240 aa  262  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  54.32 
 
 		 263 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.04 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6799  ABC transporter related  52.38 
 
 		 265 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.557054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  54.03 
 
 		 247 aa  261  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.04 
 
 		 240 aa  261  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  53.63 
 
 		 246 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  51.01 
 
 		 242 aa  261  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  53.17 
 
 		 245 aa  261  6.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  52.59 
 
 		 274 aa  261  6.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  53.04 
 
 		 256 aa  261  8.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  52.23 
 
 		 254 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.63 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1959  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  52.82 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  53.63 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  52.44 
 
 		 240 aa  261  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0870  ABC transporter related  52.21 
 
 		 269 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.42 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  53.33 
 
 		 259 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  52.44 
 
 		 255 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  51.42 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.42 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.42 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  52.8 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 263 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  51.42 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  53.63 
 
 		 261 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>