89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1201 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  48.66 
 
 		 769 aa  696    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  100 
 
 		 771 aa  1595    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  66.38 
 
 		 727 aa  901    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  65.03 
 
 		 782 aa  1033    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  48.01 
 
 		 781 aa  686    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  46.56 
 
 		 791 aa  621  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  58.68 
 
 		 543 aa  617  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  47.46 
 
 		 754 aa  612  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  48.56 
 
 		 792 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  43.45 
 
 		 752 aa  584  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  43.3 
 
 		 752 aa  585  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  45.69 
 
 		 785 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  43.89 
 
 		 786 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  42.23 
 
 		 746 aa  569  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  42.62 
 
 		 723 aa  544  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  42.22 
 
 		 723 aa  539  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  42.68 
 
 		 788 aa  540  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  45.5 
 
 		 742 aa  538  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  43.42 
 
 		 739 aa  535  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  43.88 
 
 		 742 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  42.77 
 
 		 819 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  40.67 
 
 		 761 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  39.18 
 
 		 754 aa  520  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  47.53 
 
 		 771 aa  520  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  43.24 
 
 		 914 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  44.26 
 
 		 834 aa  516  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  45.87 
 
 		 612 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  45.07 
 
 		 635 aa  504  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  44.2 
 
 		 639 aa  501  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  47.82 
 
 		 584 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  45.47 
 
 		 641 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  43.12 
 
 		 594 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  44.12 
 
 		 632 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  45.61 
 
 		 614 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  44.56 
 
 		 632 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  46.28 
 
 		 627 aa  465  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  46.28 
 
 		 627 aa  465  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  42.11 
 
 		 559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 176 aa  95.5  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  32.46 
 
 		 372 aa  95.5  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  24.85 
 
 		 375 aa  94.7  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3255  hypothetical protein  36.93 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  24.66 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  24.66 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  24.66 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  24.35 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  24.15 
 
 		 375 aa  77  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.97 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2485  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 363 aa  52.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0293375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0748  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  21.37 
 
 		 563 aa  51.2  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2204  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 346 aa  50.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187049  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1671  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  25.62 
 
 		 572 aa  50.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0635896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0781  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.26 
 
 		 368 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1170  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25 
 
 		 353 aa  48.9  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120374 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23630  PHB synthase  25 
 
 		 567 aa  48.9  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2255  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24.46 
 
 		 656 aa  48.9  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.164644  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0114  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25.64 
 
 		 357 aa  48.1  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.292099  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1870  putative poly-beta-hydroxybutyrate polymerase transmembrane protein  24.38 
 
 		 560 aa  48.1  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.107676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2022  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  21.69 
 
 		 583 aa  48.1  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.721451  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0497  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.46 
 
 		 364 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2087  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  30.19 
 
 		 586 aa  47.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1916  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24.7 
 
 		 597 aa  47.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.0385848 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1082  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase  24.63 
 
 		 604 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2331  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24.63 
 
 		 660 aa  47.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1811  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24.63 
 
 		 604 aa  47  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0777167  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0919  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  23.86 
 
 		 544 aa  47.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.510253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0085  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24.63 
 
 		 604 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1588  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24.7 
 
 		 597 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0109176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2780  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  27.73 
 
 		 601 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2166  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase  24.63 
 
 		 599 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1322  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24.63 
 
 		 632 aa  47  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.052712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2203  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase  24.63 
 
 		 604 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.384806  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0923  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  22.04 
 
 		 543 aa  47.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.635268  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3819  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24.43 
 
 		 566 aa  46.6  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557534  normal  0.0666223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0443  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24 
 
 		 594 aa  46.2  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230042  normal  0.967868 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1631  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase transmembrane protein  25 
 
 		 598 aa  45.8  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0500  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  27.08 
 
 		 634 aa  45.8  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2139  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  23.24 
 
 		 580 aa  45.8  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2492  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  27.13 
 
 		 622 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3600  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24.43 
 
 		 631 aa  45.8  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.0663038 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2276  poly-beta-hydroxybutyrate synthase  25.69 
 
 		 656 aa  45.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103313  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1512  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.56 
 
 		 356 aa  45.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117815  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1816  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  27.12 
 
 		 600 aa  45.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1681  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  22.9 
 
 		 572 aa  44.7  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.82059  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.95 
 
 		 464 aa  44.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2074  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  22.9 
 
 		 599 aa  44.7  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.683196 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0428  poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase  24.32 
 
 		 627 aa  44.7  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5804  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  25.37 
 
 		 597 aa  44.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2415  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.3 
 
 		 355 aa  44.3  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00432612  normal  0.509875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>