62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0202 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  100 
 
 		 788 aa  1614    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  53.59 
 
 		 746 aa  799    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  50.99 
 
 		 791 aa  704    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  58.66 
 
 		 771 aa  884    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  51.84 
 
 		 742 aa  707    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  48.41 
 
 		 819 aa  680    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  51.81 
 
 		 723 aa  731    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  52.36 
 
 		 742 aa  753    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  50.36 
 
 		 754 aa  706    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  48.35 
 
 		 761 aa  691    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  47.53 
 
 		 834 aa  674    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  51.69 
 
 		 723 aa  778    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  45.36 
 
 		 754 aa  622  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  42.68 
 
 		 771 aa  554  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  44.02 
 
 		 792 aa  545  1e-154  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  42.56 
 
 		 769 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  43.04 
 
 		 781 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  41.67 
 
 		 752 aa  541  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  43.57 
 
 		 782 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  41.24 
 
 		 752 aa  537  1e-151  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  44.93 
 
 		 727 aa  529  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  42.77 
 
 		 739 aa  518  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  41.18 
 
 		 785 aa  515  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  41.62 
 
 		 786 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  42.35 
 
 		 914 aa  505  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  48.22 
 
 		 543 aa  485  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  42.68 
 
 		 639 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  42.59 
 
 		 635 aa  456  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  42.74 
 
 		 632 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  41.67 
 
 		 641 aa  455  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  44.78 
 
 		 627 aa  452  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  44.78 
 
 		 627 aa  452  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  41.61 
 
 		 612 aa  445  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  42.23 
 
 		 594 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  41.57 
 
 		 632 aa  438  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  40.52 
 
 		 614 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  41.62 
 
 		 584 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  39.29 
 
 		 559 aa  399  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  29.61 
 
 		 372 aa  93.6  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 176 aa  90.1  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  27.41 
 
 		 375 aa  90.5  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  27.5 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  24.41 
 
 		 375 aa  76.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  26.39 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  26.39 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  26.39 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3255  hypothetical protein  28.42 
 
 		 309 aa  53.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.91 
 
 		 366 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.14 
 
 		 464 aa  51.6  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3093  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  27.62 
 
 		 605 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.940378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3413  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  27.62 
 
 		 605 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3286  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  27.88 
 
 		 605 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0635707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2780  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  26.61 
 
 		 601 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0500  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  30.84 
 
 		 634 aa  49.7  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5071  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  27.88 
 
 		 613 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0125848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0497  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25.11 
 
 		 364 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1381  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  26.67 
 
 		 773 aa  47.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851208 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1752  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  28.43 
 
 		 584 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.995391  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0114  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.55 
 
 		 357 aa  47  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.292099  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1512  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.73 
 
 		 356 aa  45.8  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117815  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1650  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  22.73 
 
 		 609 aa  45.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.982303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0781  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25.79 
 
 		 368 aa  44.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>