39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3197 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  100 
 
 		 176 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  69.47 
 
 		 754 aa  177  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  48.65 
 
 		 754 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  47.37 
 
 		 791 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  41.38 
 
 		 771 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  47.71 
 
 		 746 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  38.76 
 
 		 771 aa  99.4  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  45.28 
 
 		 723 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  44.55 
 
 		 727 aa  96.3  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  39.23 
 
 		 782 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  42.11 
 
 		 834 aa  95.1  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  43.86 
 
 		 819 aa  95.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  35.66 
 
 		 788 aa  91.7  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  42.06 
 
 		 742 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  42.34 
 
 		 543 aa  89.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  42.45 
 
 		 742 aa  88.6  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  38.53 
 
 		 792 aa  87.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  41.12 
 
 		 785 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  42.61 
 
 		 781 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  42.99 
 
 		 739 aa  84.3  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  40.87 
 
 		 769 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  39.62 
 
 		 723 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  37.74 
 
 		 752 aa  82.8  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  37.74 
 
 		 752 aa  82.8  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  40 
 
 		 761 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  39.52 
 
 		 614 aa  77.8  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  38.32 
 
 		 786 aa  77.4  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  35.66 
 
 		 639 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  37.84 
 
 		 627 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  37.84 
 
 		 627 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  35.66 
 
 		 612 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  31.15 
 
 		 559 aa  72.8  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  34.65 
 
 		 635 aa  72  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  35.66 
 
 		 632 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  35.94 
 
 		 632 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  35.29 
 
 		 641 aa  68.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  32.81 
 
 		 584 aa  67.8  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  36.75 
 
 		 594 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  34.48 
 
 		 914 aa  61.6  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>