56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_03910 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  100 
 
 		 914 aa  1853    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  47.4 
 
 		 791 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  46.8 
 
 		 754 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  45.67 
 
 		 746 aa  568  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  45.8 
 
 		 723 aa  557  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  44.88 
 
 		 742 aa  549  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  39.18 
 
 		 752 aa  547  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  45.45 
 
 		 739 aa  546  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  38.9 
 
 		 752 aa  545  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  43.24 
 
 		 771 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  43.87 
 
 		 742 aa  535  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  42.98 
 
 		 781 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  44.28 
 
 		 819 aa  525  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  42.79 
 
 		 782 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  44.28 
 
 		 769 aa  519  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  39.73 
 
 		 834 aa  517  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  43.96 
 
 		 771 aa  513  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  40.29 
 
 		 785 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  42.35 
 
 		 788 aa  511  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  45.44 
 
 		 727 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  41.89 
 
 		 761 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  41.89 
 
 		 792 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  42.32 
 
 		 723 aa  505  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  45.12 
 
 		 639 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  46.86 
 
 		 635 aa  481  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  40.83 
 
 		 786 aa  478  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  48.23 
 
 		 543 aa  475  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  46.99 
 
 		 612 aa  472  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  39.68 
 
 		 754 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  46.73 
 
 		 632 aa  455  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  46.8 
 
 		 641 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  47.01 
 
 		 632 aa  456  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  44.54 
 
 		 614 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  44.04 
 
 		 584 aa  438  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  45.26 
 
 		 594 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  45.52 
 
 		 627 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  45.52 
 
 		 627 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  41.05 
 
 		 559 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  25.36 
 
 		 375 aa  77.4  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 176 aa  77  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  24.66 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  25.25 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  26.74 
 
 		 373 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  26.74 
 
 		 373 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  26.74 
 
 		 373 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3255  hypothetical protein  29.05 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  22.64 
 
 		 375 aa  63.9  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2415  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.08 
 
 		 355 aa  63.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00432612  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2485  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 363 aa  53.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0293375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0497  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.46 
 
 		 364 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1512  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.53 
 
 		 356 aa  52.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.86 
 
 		 366 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2204  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 346 aa  50.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187049  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0114  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  21.8 
 
 		 357 aa  48.9  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.292099  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0781  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.1 
 
 		 368 aa  45.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  33.56 
 
 		 938 aa  44.7  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>