64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44010 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  53.01 
 
 		 781 aa  675    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  66.38 
 
 		 771 aa  954    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  64.12 
 
 		 782 aa  921    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  53.87 
 
 		 769 aa  693    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  100 
 
 		 727 aa  1468    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  59.8 
 
 		 543 aa  624  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  47.13 
 
 		 791 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  47.88 
 
 		 792 aa  600  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  48.23 
 
 		 754 aa  600  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  43.81 
 
 		 752 aa  598  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  43.81 
 
 		 752 aa  595  1e-169  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  45.34 
 
 		 785 aa  568  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  44.15 
 
 		 786 aa  557  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  44.82 
 
 		 788 aa  541  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  43.43 
 
 		 746 aa  540  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  43.3 
 
 		 742 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  45.96 
 
 		 739 aa  525  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  44.49 
 
 		 771 aa  525  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  45.24 
 
 		 914 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  41.9 
 
 		 723 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  39.7 
 
 		 754 aa  509  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  41.49 
 
 		 723 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  38.75 
 
 		 834 aa  502  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  42.59 
 
 		 742 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  41.28 
 
 		 761 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  41.57 
 
 		 819 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  47.37 
 
 		 635 aa  479  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  48.09 
 
 		 612 aa  481  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  48.52 
 
 		 614 aa  481  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  46.57 
 
 		 639 aa  474  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  47.71 
 
 		 627 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  47.71 
 
 		 627 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  48.92 
 
 		 584 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  46.39 
 
 		 632 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  47.11 
 
 		 594 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  46.67 
 
 		 641 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  47.13 
 
 		 632 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  43.14 
 
 		 559 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  28.62 
 
 		 375 aa  95.9  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  33.33 
 
 		 372 aa  94.4  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  46.81 
 
 		 176 aa  92.8  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3255  hypothetical protein  40.33 
 
 		 309 aa  83.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  26.55 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  25.73 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  25.73 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  25.73 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  25.37 
 
 		 381 aa  72  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.8 
 
 		 366 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0114  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.75 
 
 		 357 aa  53.1  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.292099  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0748  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  22.92 
 
 		 563 aa  49.7  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0497  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.49 
 
 		 364 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.91 
 
 		 464 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0188  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain protein  25 
 
 		 617 aa  45.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1631  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase transmembrane protein  26.58 
 
 		 598 aa  45.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2331  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  25.66 
 
 		 660 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121223  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1322  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  25.66 
 
 		 632 aa  45.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.052712  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1082  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase  25.66 
 
 		 604 aa  45.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2203  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase  25.66 
 
 		 604 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.384806  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2166  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase  25.66 
 
 		 599 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0085  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  25.66 
 
 		 604 aa  45.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1811  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  25.66 
 
 		 604 aa  45.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0777167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2485  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 363 aa  45.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0293375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1870  putative poly-beta-hydroxybutyrate polymerase transmembrane protein  26.52 
 
 		 560 aa  44.7  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.107676 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2455  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.75 
 
 		 530 aa  44.3  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>