67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0371 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  100 
 
 		 786 aa  1596    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  51.93 
 
 		 792 aa  709    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  62.76 
 
 		 785 aa  997    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  42.82 
 
 		 771 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  44.76 
 
 		 791 aa  568  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  42.28 
 
 		 781 aa  572  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  43.63 
 
 		 769 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  42.33 
 
 		 782 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  40.62 
 
 		 754 aa  551  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  45.36 
 
 		 727 aa  539  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  40.83 
 
 		 752 aa  540  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  40.69 
 
 		 752 aa  534  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  42.11 
 
 		 742 aa  525  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  39.6 
 
 		 746 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  40.49 
 
 		 723 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  39.74 
 
 		 771 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  50.21 
 
 		 543 aa  508  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  40.14 
 
 		 723 aa  502  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  41.62 
 
 		 788 aa  497  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  40.96 
 
 		 739 aa  490  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  39.34 
 
 		 754 aa  485  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  46.75 
 
 		 641 aa  483  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  40.33 
 
 		 834 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  38.75 
 
 		 761 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  46.9 
 
 		 632 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  38.58 
 
 		 819 aa  478  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  45.74 
 
 		 632 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  39.45 
 
 		 742 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  44.36 
 
 		 627 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  41.38 
 
 		 635 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  44.36 
 
 		 627 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  40.74 
 
 		 914 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  43.79 
 
 		 612 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  42.59 
 
 		 639 aa  455  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  43.42 
 
 		 584 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  42.91 
 
 		 594 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  43.97 
 
 		 614 aa  445  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  41.7 
 
 		 559 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  27.16 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  32.43 
 
 		 372 aa  91.3  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  27 
 
 		 381 aa  83.2  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  26.69 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  28.09 
 
 		 373 aa  72  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  28.09 
 
 		 373 aa  72  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  28.09 
 
 		 373 aa  72  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2485  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0293375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0991  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase subunit PhaC  22.69 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.550806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.19 
 
 		 366 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0781  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  28.49 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3255  hypothetical protein  30.22 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.11 
 
 		 464 aa  57  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0497  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.89 
 
 		 364 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0629  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 		 368 aa  54.7  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2415  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.61 
 
 		 355 aa  53.5  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00432612  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0991  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.63 
 
 		 464 aa  53.5  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0748  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  23.95 
 
 		 563 aa  52.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0114  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  20.98 
 
 		 357 aa  51.6  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.292099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2400  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  28.29 
 
 		 376 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.661359 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000517  polyhydroxyalkanoic acid synthase  23.12 
 
 		 591 aa  49.3  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0993  Alpha/beta hydrolase fold:Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase, N-terminal  22.96 
 
 		 582 aa  48.9  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00929  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase (Poly(3-hydroxybutyrate) polymerase) (PHB polymerase) (PHB synthase) (Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase)  24.58 
 
 		 354 aa  47.8  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0858058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1512  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.11 
 
 		 356 aa  47.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117815  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2385  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.14 
 
 		 358 aa  47.8  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.767924  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2455  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  21.53 
 
 		 530 aa  46.2  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1170  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.19 
 
 		 353 aa  45.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120374 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05368  hypothetical protein  21.59 
 
 		 591 aa  44.3  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>