53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4907 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  60.71 
 
 		 627 aa  644    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  66.09 
 
 		 635 aa  789    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  61.37 
 
 		 594 aa  721    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  60.71 
 
 		 627 aa  644    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  87.34 
 
 		 632 aa  1139    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  100 
 
 		 632 aa  1290    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  83.04 
 
 		 641 aa  973    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  60.25 
 
 		 584 aa  716    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  66.61 
 
 		 639 aa  793    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  66.73 
 
 		 612 aa  780    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  54.39 
 
 		 614 aa  618  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  52.01 
 
 		 559 aa  588  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  47.36 
 
 		 791 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  46.52 
 
 		 754 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  47.19 
 
 		 782 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  47.64 
 
 		 786 aa  477  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  48.45 
 
 		 781 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  42.75 
 
 		 752 aa  468  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  46.98 
 
 		 792 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  44.56 
 
 		 771 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  41.77 
 
 		 752 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  50.1 
 
 		 543 aa  463  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  41.87 
 
 		 742 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  48.42 
 
 		 739 aa  459  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  46.8 
 
 		 769 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  42.79 
 
 		 723 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  44.85 
 
 		 785 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  43.19 
 
 		 761 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  43.82 
 
 		 723 aa  449  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  41.82 
 
 		 819 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  44.62 
 
 		 742 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  46.23 
 
 		 727 aa  445  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  43.34 
 
 		 834 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  46.73 
 
 		 914 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  41.86 
 
 		 746 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  42.73 
 
 		 788 aa  431  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  41.92 
 
 		 771 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  41.03 
 
 		 754 aa  396  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  24.93 
 
 		 375 aa  91.3  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  30.23 
 
 		 372 aa  77  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  26.01 
 
 		 373 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  26.01 
 
 		 373 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  26.01 
 
 		 373 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  23.03 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  24.16 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2485  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 363 aa  54.7  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0293375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.16 
 
 		 464 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.18 
 
 		 366 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23630  PHB synthase  23.02 
 
 		 567 aa  49.3  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1512  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.75 
 
 		 356 aa  47.4  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117815  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0114  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  19.84 
 
 		 357 aa  45.4  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.292099  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1170  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.72 
 
 		 353 aa  45.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>