66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2976 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  51.93 
 
 		 786 aa  721    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  46.96 
 
 		 785 aa  699    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  49.08 
 
 		 782 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  100 
 
 		 792 aa  1598    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  48.56 
 
 		 771 aa  617  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  46.23 
 
 		 754 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  43.6 
 
 		 752 aa  604  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  43.45 
 
 		 752 aa  601  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  44.3 
 
 		 791 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  46.29 
 
 		 769 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  43.48 
 
 		 746 aa  576  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  48.24 
 
 		 727 aa  573  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  45.36 
 
 		 781 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  44.19 
 
 		 742 aa  556  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  42.54 
 
 		 771 aa  558  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  42.41 
 
 		 723 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  42.28 
 
 		 819 aa  545  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  44.02 
 
 		 788 aa  541  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  42.21 
 
 		 723 aa  534  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  44.9 
 
 		 739 aa  531  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  43.2 
 
 		 761 aa  525  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  40.94 
 
 		 834 aa  519  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  41.85 
 
 		 742 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  51.12 
 
 		 543 aa  505  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  40.51 
 
 		 754 aa  500  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  41.89 
 
 		 914 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  47.39 
 
 		 635 aa  488  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  47.09 
 
 		 639 aa  488  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  47.45 
 
 		 612 aa  487  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  46.98 
 
 		 632 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  47.03 
 
 		 641 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  46.51 
 
 		 614 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  46.72 
 
 		 627 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  46.72 
 
 		 627 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  46.39 
 
 		 632 aa  462  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  44.65 
 
 		 594 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  44.91 
 
 		 584 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  41.35 
 
 		 559 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  30.34 
 
 		 375 aa  97.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  30.67 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  31.39 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  38.83 
 
 		 176 aa  84  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3255  hypothetical protein  32.7 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  25.97 
 
 		 373 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  25.97 
 
 		 373 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  25.97 
 
 		 373 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2485  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0293375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.19 
 
 		 464 aa  63.9  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.93 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  23.76 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0497  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1671  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  25.15 
 
 		 572 aa  52  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0635896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0991  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.58 
 
 		 464 aa  51.6  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2455  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.03 
 
 		 530 aa  49.3  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0781  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.46 
 
 		 368 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1170  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25.52 
 
 		 353 aa  49.3  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0629  alpha/beta hydrolase fold protein  24.04 
 
 		 368 aa  48.9  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0748  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  23.62 
 
 		 563 aa  48.1  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2400  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.49 
 
 		 376 aa  47.8  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.661359 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2385  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.54 
 
 		 358 aa  47.8  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.767924  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23630  PHB synthase  22.69 
 
 		 567 aa  47.8  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2415  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25.57 
 
 		 355 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00432612  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0188  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain protein  23.91 
 
 		 617 aa  45.8  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1512  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25.44 
 
 		 356 aa  45.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117815  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2087  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  30.19 
 
 		 586 aa  44.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00929  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase (Poly(3-hydroxybutyrate) polymerase) (PHB polymerase) (PHB synthase) (Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase)  24.24 
 
 		 354 aa  44.3  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0858058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>