79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2635 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  64.12 
 
 		 727 aa  872    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  50.82 
 
 		 781 aa  697    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  49.08 
 
 		 792 aa  639    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  51.89 
 
 		 769 aa  701    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  65.03 
 
 		 771 aa  1043    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  100 
 
 		 782 aa  1600    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  45.18 
 
 		 752 aa  609  1e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  56.93 
 
 		 543 aa  612  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  43.94 
 
 		 752 aa  605  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  46.05 
 
 		 754 aa  594  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  44.57 
 
 		 791 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  43.47 
 
 		 785 aa  582  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  43.4 
 
 		 786 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  41.31 
 
 		 746 aa  553  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  44.07 
 
 		 739 aa  543  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  47.65 
 
 		 742 aa  542  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  43.72 
 
 		 819 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  47.1 
 
 		 723 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  43.18 
 
 		 771 aa  530  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  43.02 
 
 		 788 aa  527  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  40.42 
 
 		 834 aa  519  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  40.36 
 
 		 754 aa  521  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  42.82 
 
 		 761 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  41.81 
 
 		 723 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  41.87 
 
 		 742 aa  512  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  42.81 
 
 		 914 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  45.55 
 
 		 635 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  45.64 
 
 		 612 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  44.8 
 
 		 639 aa  489  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  46.17 
 
 		 594 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  46.73 
 
 		 641 aa  484  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  45.95 
 
 		 614 aa  482  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  47.19 
 
 		 632 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  46.62 
 
 		 632 aa  477  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  46.46 
 
 		 584 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  45.55 
 
 		 627 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  45.55 
 
 		 627 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  45.27 
 
 		 559 aa  458  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  32.9 
 
 		 372 aa  95.1  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  26.85 
 
 		 375 aa  94.4  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 176 aa  92.4  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3255  hypothetical protein  36.61 
 
 		 309 aa  87  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  25.44 
 
 		 375 aa  73.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  23.89 
 
 		 381 aa  72  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  24.12 
 
 		 373 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  24.12 
 
 		 373 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  24.12 
 
 		 373 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25 
 
 		 366 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0114  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25.45 
 
 		 357 aa  53.5  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.292099  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0748  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain-containing protein  22.27 
 
 		 563 aa  53.9  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2485  alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 		 363 aa  50.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0293375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0188  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase domain protein  26.09 
 
 		 617 aa  48.9  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0428  poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase  23.67 
 
 		 627 aa  48.5  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1671  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  23.91 
 
 		 572 aa  48.9  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0635896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2415  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.97 
 
 		 355 aa  48.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00432612  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0497  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.26 
 
 		 364 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23630  PHB synthase  23.62 
 
 		 567 aa  46.2  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.32 
 
 		 464 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2255  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  23.02 
 
 		 656 aa  46.6  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.164644  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2780  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24.14 
 
 		 601 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0443  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  22.93 
 
 		 594 aa  45.8  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230042  normal  0.967868 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2331  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  22.7 
 
 		 660 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121223  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2166  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase  22.7 
 
 		 599 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00929  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase (Poly(3-hydroxybutyrate) polymerase) (PHB polymerase) (PHB synthase) (Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase)  23.21 
 
 		 354 aa  44.7  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0858058  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5780  alpha/beta hydrolase fold protein  22.37 
 
 		 369 aa  45.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.390306  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1322  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  23.24 
 
 		 632 aa  44.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.052712  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3413  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  23.13 
 
 		 605 aa  44.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3600  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24.5 
 
 		 631 aa  44.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.0663038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3093  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  23.13 
 
 		 605 aa  45.1  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.940378 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2203  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase  22.7 
 
 		 604 aa  44.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.384806  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1082  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase  23.24 
 
 		 604 aa  44.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226375  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1681  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  22.62 
 
 		 572 aa  44.7  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.82059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0085  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  23.24 
 
 		 604 aa  44.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1811  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  23.24 
 
 		 604 aa  44.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0777167  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2492  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  27.27 
 
 		 622 aa  44.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1870  putative poly-beta-hydroxybutyrate polymerase transmembrane protein  24.38 
 
 		 560 aa  44.3  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.107676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0781  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.16 
 
 		 368 aa  44.3  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2074  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  22.62 
 
 		 599 aa  44.3  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.683196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1816  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  26.27 
 
 		 600 aa  44.3  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>