56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0756 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  51.87 
 
 		 746 aa  733    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  50.92 
 
 		 723 aa  706    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  51.34 
 
 		 771 aa  685    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  62.69 
 
 		 834 aa  1037    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  100 
 
 		 819 aa  1665    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  63.43 
 
 		 742 aa  903    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  48.38 
 
 		 754 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  52.41 
 
 		 742 aa  725    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  52.24 
 
 		 723 aa  745    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  48.41 
 
 		 788 aa  667    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  49.48 
 
 		 791 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  58.21 
 
 		 761 aa  850    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  46.68 
 
 		 754 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  43.34 
 
 		 739 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  43.72 
 
 		 782 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  42.28 
 
 		 792 aa  530  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  43.64 
 
 		 781 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  42.77 
 
 		 771 aa  522  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  41.67 
 
 		 914 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  42.99 
 
 		 769 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  38.84 
 
 		 785 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  37.37 
 
 		 752 aa  488  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  37 
 
 		 752 aa  485  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  38.63 
 
 		 786 aa  477  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  43.81 
 
 		 727 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  43.01 
 
 		 639 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  43.13 
 
 		 635 aa  464  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  47.38 
 
 		 543 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  43.57 
 
 		 641 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  42.99 
 
 		 612 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  43.47 
 
 		 632 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  41.82 
 
 		 632 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  42.18 
 
 		 584 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  42.88 
 
 		 627 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  42.88 
 
 		 627 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  41.68 
 
 		 594 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  41.59 
 
 		 614 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  38.86 
 
 		 559 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  27.13 
 
 		 375 aa  97.4  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  44.86 
 
 		 176 aa  92.8  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  32.04 
 
 		 372 aa  88.2  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  27.06 
 
 		 373 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  27.06 
 
 		 373 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  27.06 
 
 		 373 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  22.96 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  25.65 
 
 		 381 aa  66.6  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3255  hypothetical protein  28.51 
 
 		 309 aa  63.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.66 
 
 		 366 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  21.95 
 
 		 464 aa  52  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.68 
 
 		 261 aa  50.8  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0114  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.39 
 
 		 357 aa  47.8  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.292099  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0863  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  32.76 
 
 		 591 aa  47.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.51952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0497  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  21.93 
 
 		 364 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0500  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  27.86 
 
 		 634 aa  46.2  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2400  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.83 
 
 		 376 aa  45.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.661359 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  40.74 
 
 		 840 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>