55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1566 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  48.49 
 
 		 771 aa  697    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  51.79 
 
 		 782 aa  696    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  100 
 
 		 769 aa  1538    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  72.3 
 
 		 543 aa  791    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  52.79 
 
 		 727 aa  654    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  76.42 
 
 		 781 aa  1152    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  44.97 
 
 		 752 aa  614  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  45.26 
 
 		 752 aa  613  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  47.65 
 
 		 791 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  43.12 
 
 		 785 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  45.19 
 
 		 754 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  45.78 
 
 		 792 aa  570  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  43.92 
 
 		 786 aa  565  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  43.18 
 
 		 746 aa  555  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  43.83 
 
 		 742 aa  555  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  45.48 
 
 		 742 aa  544  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  44.49 
 
 		 723 aa  541  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  42.05 
 
 		 723 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  42.56 
 
 		 788 aa  530  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  44.44 
 
 		 739 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  43.43 
 
 		 834 aa  527  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  41.8 
 
 		 771 aa  513  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  40.94 
 
 		 819 aa  511  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  41.41 
 
 		 761 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  43.21 
 
 		 914 aa  502  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  47.74 
 
 		 612 aa  480  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  47.93 
 
 		 635 aa  479  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  47.82 
 
 		 632 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  46.67 
 
 		 639 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  48.08 
 
 		 614 aa  478  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  46.99 
 
 		 641 aa  469  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  40 
 
 		 754 aa  469  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  51.34 
 
 		 632 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  46.69 
 
 		 594 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  45.6 
 
 		 584 aa  442  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  46.78 
 
 		 627 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  46.78 
 
 		 627 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  42.83 
 
 		 559 aa  438  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3255  hypothetical protein  45.07 
 
 		 309 aa  152  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  26.85 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  33.48 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  28.42 
 
 		 373 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  28.42 
 
 		 373 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  28.42 
 
 		 373 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 176 aa  82.4  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  25.35 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  27 
 
 		 381 aa  67  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5780  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.390306  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0781  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.52 
 
 		 368 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23630  PHB synthase  22.31 
 
 		 567 aa  48.5  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.93 
 
 		 366 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2485  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 363 aa  47.8  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0293375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0114  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25.88 
 
 		 357 aa  45.8  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.292099  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1509  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  29.36 
 
 		 677 aa  45.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.321101  normal  0.417915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2400  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.49 
 
 		 376 aa  44.3  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.661359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>