55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2348 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  100 
 
 		 559 aa  1174    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  55.03 
 
 		 635 aa  635    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  55.03 
 
 		 612 aa  634  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  54.84 
 
 		 639 aa  632  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  52.89 
 
 		 632 aa  615  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  51.54 
 
 		 641 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  52.01 
 
 		 632 aa  596  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  52.21 
 
 		 584 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  50.56 
 
 		 627 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  50.56 
 
 		 627 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  49.35 
 
 		 594 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  48.21 
 
 		 614 aa  532  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  45.27 
 
 		 782 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  42.11 
 
 		 771 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  42.78 
 
 		 781 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  45.6 
 
 		 543 aa  455  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  42.83 
 
 		 769 aa  452  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  43.01 
 
 		 791 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  41.71 
 
 		 754 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  43.14 
 
 		 727 aa  442  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  41.89 
 
 		 786 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  41.35 
 
 		 792 aa  430  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  40.29 
 
 		 742 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  40.66 
 
 		 752 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  40.8 
 
 		 752 aa  430  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  41.87 
 
 		 785 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  39.24 
 
 		 746 aa  421  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  42.26 
 
 		 739 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  38.86 
 
 		 819 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  38.49 
 
 		 723 aa  411  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  41.92 
 
 		 771 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  39.43 
 
 		 761 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  40.58 
 
 		 742 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  39.29 
 
 		 788 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  38.99 
 
 		 834 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  38.27 
 
 		 723 aa  398  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  41.05 
 
 		 914 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  37.32 
 
 		 754 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  23.83 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 176 aa  71.6  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  25.57 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  21.75 
 
 		 375 aa  66.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  23.77 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  22.48 
 
 		 373 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  22.48 
 
 		 373 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  22.48 
 
 		 373 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0114  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.91 
 
 		 357 aa  52.8  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.292099  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.31 
 
 		 366 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0781  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  21.31 
 
 		 368 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0752  polyhydroxyalkanoate depolymerase, intracellular  31.3 
 
 		 446 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2415  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.7 
 
 		 355 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00432612  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1836  polyhydroxyalkanoate depolymerase, intracellular  26 
 
 		 422 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4709  polyhydroxyalkanoate depolymerase, intracellular  30.53 
 
 		 446 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5780  alpha/beta hydrolase fold protein  20.83 
 
 		 369 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.390306  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00929  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase (Poly(3-hydroxybutyrate) polymerase) (PHB polymerase) (PHB synthase) (Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase)  26.57 
 
 		 354 aa  44.3  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0858058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>