64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2654 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  62.76 
 
 		 786 aa  985    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  100 
 
 		 785 aa  1593    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  46.96 
 
 		 792 aa  692    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  44.35 
 
 		 791 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  44.2 
 
 		 769 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  45.69 
 
 		 771 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  43.47 
 
 		 782 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  45.05 
 
 		 754 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  43.21 
 
 		 781 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  40.22 
 
 		 752 aa  560  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  39.86 
 
 		 752 aa  551  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  47.82 
 
 		 727 aa  548  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  42.56 
 
 		 742 aa  544  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  39.55 
 
 		 746 aa  536  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  41.02 
 
 		 723 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  39.53 
 
 		 771 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  50.53 
 
 		 543 aa  512  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  40.18 
 
 		 739 aa  500  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  41.18 
 
 		 788 aa  501  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  42.36 
 
 		 723 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  41.03 
 
 		 834 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  40.29 
 
 		 914 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  39.5 
 
 		 754 aa  492  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  38.84 
 
 		 819 aa  489  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  40.75 
 
 		 742 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  38.12 
 
 		 761 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  44.85 
 
 		 632 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  44.53 
 
 		 641 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  39.39 
 
 		 639 aa  444  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  40.65 
 
 		 612 aa  443  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  40.58 
 
 		 635 aa  445  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  41.35 
 
 		 632 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  40.7 
 
 		 627 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  40.7 
 
 		 627 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  42.08 
 
 		 614 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  41.83 
 
 		 584 aa  422  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  41.87 
 
 		 559 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  42.12 
 
 		 594 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  28.57 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  34.92 
 
 		 372 aa  88.2  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 176 aa  85.9  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  26.58 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  26.58 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  26.58 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  27.39 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3255  hypothetical protein  33.15 
 
 		 309 aa  73.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  26.27 
 
 		 375 aa  72  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.51 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2385  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  29.55 
 
 		 358 aa  55.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.767924  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2485  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 363 aa  54.7  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0293375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0781  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.27 
 
 		 368 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0497  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.89 
 
 		 364 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00929  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase (Poly(3-hydroxybutyrate) polymerase) (PHB polymerase) (PHB synthase) (Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase)  26.64 
 
 		 354 aa  50.8  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0858058  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0114  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.38 
 
 		 357 aa  50.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.292099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1044  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.88 
 
 		 361 aa  47.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0629  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 368 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1232  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.88 
 
 		 361 aa  47.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2400  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  27.23 
 
 		 376 aa  47.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.661359 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.61 
 
 		 464 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0991  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.55 
 
 		 464 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1512  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.8 
 
 		 356 aa  45.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117815  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2415  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.72 
 
 		 355 aa  45.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00432612  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1170  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.01 
 
 		 353 aa  44.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120374 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0991  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase subunit PhaC  23.49 
 
 		 354 aa  43.9  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.550806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>