58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0627 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  51.58 
 
 		 746 aa  742    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  48.31 
 
 		 834 aa  670    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  50.14 
 
 		 771 aa  666    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  51.9 
 
 		 723 aa  711    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  49.48 
 
 		 819 aa  640    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  49.93 
 
 		 742 aa  670    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  70.7 
 
 		 754 aa  1083    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  51.67 
 
 		 742 aa  730    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  50.99 
 
 		 788 aa  689    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  100 
 
 		 791 aa  1614    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  50.72 
 
 		 761 aa  685    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  50.22 
 
 		 723 aa  634  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  46.56 
 
 		 771 aa  621  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  48.1 
 
 		 781 aa  608  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  47.65 
 
 		 769 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  44.96 
 
 		 754 aa  592  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  47.4 
 
 		 914 aa  586  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  44.87 
 
 		 782 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  51.45 
 
 		 727 aa  583  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  44.35 
 
 		 785 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  47.2 
 
 		 739 aa  580  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  44.3 
 
 		 792 aa  570  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  44.63 
 
 		 786 aa  568  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  42.23 
 
 		 752 aa  566  1e-160  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  42.15 
 
 		 752 aa  562  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  55.88 
 
 		 543 aa  551  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  49.2 
 
 		 639 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  47.97 
 
 		 635 aa  524  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  49.27 
 
 		 612 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  48.63 
 
 		 632 aa  505  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  47.36 
 
 		 632 aa  501  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  49.37 
 
 		 641 aa  501  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  48.27 
 
 		 594 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  49.64 
 
 		 627 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  49.64 
 
 		 627 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  47.36 
 
 		 584 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  48.5 
 
 		 614 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  43.01 
 
 		 559 aa  436  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  46.9 
 
 		 176 aa  100  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  27.14 
 
 		 375 aa  97.8  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  30.94 
 
 		 372 aa  80.5  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  24.75 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  25.65 
 
 		 373 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  25.65 
 
 		 373 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  25.65 
 
 		 373 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3255  hypothetical protein  28.19 
 
 		 309 aa  60.1  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  25.43 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.61 
 
 		 366 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2780  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  26.36 
 
 		 601 aa  48.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23630  PHB synthase  23.47 
 
 		 567 aa  45.8  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1671  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  21.3 
 
 		 572 aa  45.8  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0635896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3286  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24.76 
 
 		 605 aa  45.4  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0635707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2819  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  25 
 
 		 601 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0247159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3413  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24.53 
 
 		 605 aa  45.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3093  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24.53 
 
 		 605 aa  45.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.940378 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5071  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  27.62 
 
 		 613 aa  45.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0125848 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.38 
 
 		 464 aa  44.3  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2276  poly-beta-hydroxybutyrate synthase  26.13 
 
 		 656 aa  44.3  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>