58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2100 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  100 
 
 		 752 aa  1543    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  97.61 
 
 		 752 aa  1511    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  42.61 
 
 		 781 aa  617  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  44.97 
 
 		 769 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  45.18 
 
 		 782 aa  601  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  43.6 
 
 		 792 aa  597  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  43.45 
 
 		 771 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  42.2 
 
 		 754 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  44.88 
 
 		 727 aa  569  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  42.23 
 
 		 791 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  40.22 
 
 		 785 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  42.78 
 
 		 771 aa  558  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  41.62 
 
 		 746 aa  545  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  39.8 
 
 		 742 aa  543  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  40.83 
 
 		 786 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  41.6 
 
 		 723 aa  542  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  39.94 
 
 		 723 aa  533  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  41.67 
 
 		 788 aa  527  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  40.72 
 
 		 761 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.18 
 
 		 914 aa  527  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  50.21 
 
 		 543 aa  523  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  39.85 
 
 		 739 aa  511  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  39.83 
 
 		 834 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  39.49 
 
 		 742 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  44.95 
 
 		 635 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  44.77 
 
 		 639 aa  488  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  42 
 
 		 612 aa  488  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  37.37 
 
 		 819 aa  488  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  36.87 
 
 		 754 aa  476  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  42.11 
 
 		 632 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  42.75 
 
 		 632 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  42.93 
 
 		 641 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  41.92 
 
 		 614 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  43.22 
 
 		 594 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  41.39 
 
 		 584 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  43.16 
 
 		 627 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  43.16 
 
 		 627 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  40.8 
 
 		 559 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  28.48 
 
 		 375 aa  98.6  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 176 aa  81.6  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3255  hypothetical protein  28.04 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  22.7 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  27.27 
 
 		 372 aa  69.3  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  22.26 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  22.26 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  22.26 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.67 
 
 		 464 aa  63.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  26.32 
 
 		 381 aa  60.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  28.19 
 
 		 366 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0991  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.81 
 
 		 464 aa  54.7  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5780  alpha/beta hydrolase fold protein  24.39 
 
 		 369 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.390306  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2415  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25.09 
 
 		 355 aa  52.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00432612  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1512  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.77 
 
 		 356 aa  50.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117815  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0497  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25.56 
 
 		 364 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2455  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.79 
 
 		 530 aa  48.1  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2485  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 		 363 aa  47.8  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0293375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2400  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  25.63 
 
 		 376 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.661359 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2204  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 346 aa  46.2  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>