63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2452 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  51.25 
 
 		 754 aa  728    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  48.63 
 
 		 754 aa  672    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  66.1 
 
 		 723 aa  980    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  53.76 
 
 		 771 aa  740    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  51.33 
 
 		 834 aa  753    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  51.87 
 
 		 819 aa  734    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  54.87 
 
 		 742 aa  788    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  53.96 
 
 		 761 aa  757    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  67.08 
 
 		 742 aa  1025    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  52.45 
 
 		 723 aa  752    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  100 
 
 		 746 aa  1536    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  51.58 
 
 		 791 aa  742    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  53.59 
 
 		 788 aa  785    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  45.59 
 
 		 739 aa  574  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  42.23 
 
 		 771 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  43.48 
 
 		 792 aa  566  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  42.55 
 
 		 781 aa  561  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  43.18 
 
 		 769 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  45.67 
 
 		 914 aa  548  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  41.86 
 
 		 782 aa  548  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  41.62 
 
 		 752 aa  545  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  41.34 
 
 		 752 aa  539  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  39.55 
 
 		 785 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  46.96 
 
 		 727 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  39.6 
 
 		 786 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  49.69 
 
 		 543 aa  502  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  45.29 
 
 		 639 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  44.98 
 
 		 635 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  42.47 
 
 		 614 aa  458  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  43.72 
 
 		 612 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  43.66 
 
 		 632 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  42.62 
 
 		 641 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  43.14 
 
 		 594 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  41.86 
 
 		 632 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  41.52 
 
 		 627 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  41.52 
 
 		 627 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  41.27 
 
 		 584 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  39.24 
 
 		 559 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  47.71 
 
 		 176 aa  100  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  24.49 
 
 		 375 aa  96.3  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  25.42 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  26.34 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  26.34 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  26.34 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  24.29 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  22.92 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0781  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.65 
 
 		 368 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.67 
 
 		 366 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0500  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  29.51 
 
 		 634 aa  51.6  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2485  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 363 aa  49.7  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0293375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2400  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.72 
 
 		 376 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.661359 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  19.57 
 
 		 464 aa  48.9  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2204  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 		 346 aa  48.5  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187049  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2415  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  21.71 
 
 		 355 aa  47.8  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00432612  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2492  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24.17 
 
 		 622 aa  47.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3255  hypothetical protein  24.08 
 
 		 309 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5780  alpha/beta hydrolase fold protein  24.22 
 
 		 369 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.390306  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2780  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24.55 
 
 		 601 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0991  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  19.64 
 
 		 464 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0497  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  21.33 
 
 		 364 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1512  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  19.91 
 
 		 356 aa  45.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117815  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0114  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.27 
 
 		 357 aa  45.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.292099  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2276  poly-beta-hydroxybutyrate synthase  25.69 
 
 		 656 aa  44.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>