52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3684 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  100 
 
 		 761 aa  1561    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  53.96 
 
 		 746 aa  763    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  50.72 
 
 		 791 aa  690    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  50.5 
 
 		 788 aa  684    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  50.48 
 
 		 771 aa  674    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  51.24 
 
 		 723 aa  718    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  53.91 
 
 		 742 aa  751    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  48.68 
 
 		 754 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  61.81 
 
 		 742 aa  922    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  58.21 
 
 		 819 aa  859    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  59.21 
 
 		 834 aa  877    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  51.51 
 
 		 723 aa  727    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  46.71 
 
 		 754 aa  630  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  43.07 
 
 		 739 aa  559  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  42.9 
 
 		 781 aa  537  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  40.72 
 
 		 752 aa  535  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  40.35 
 
 		 752 aa  528  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  40.67 
 
 		 771 aa  528  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  42.82 
 
 		 782 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  43.2 
 
 		 792 aa  521  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  41.61 
 
 		 769 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  47.36 
 
 		 727 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  44.42 
 
 		 639 aa  491  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  38.82 
 
 		 786 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  41.89 
 
 		 914 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  38.12 
 
 		 785 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  44.42 
 
 		 635 aa  485  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  44.06 
 
 		 612 aa  478  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  43.76 
 
 		 632 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  42.91 
 
 		 641 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  43.54 
 
 		 627 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  43.54 
 
 		 627 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  43.19 
 
 		 632 aa  459  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  42.93 
 
 		 584 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  43.16 
 
 		 614 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  45.12 
 
 		 543 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  40.79 
 
 		 594 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  39.43 
 
 		 559 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  27.67 
 
 		 372 aa  89.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  40 
 
 		 176 aa  81.3  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  25.19 
 
 		 375 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  25.31 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  24.15 
 
 		 373 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  24.15 
 
 		 373 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  24.15 
 
 		 373 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  25.2 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3255  hypothetical protein  27.39 
 
 		 309 aa  62  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  20.65 
 
 		 464 aa  53.9  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0500  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  29.63 
 
 		 634 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5804  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  30.19 
 
 		 597 aa  45.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6027  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  30.19 
 
 		 597 aa  44.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.436418  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5071  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  26.67 
 
 		 613 aa  44.3  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0125848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>