60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1557 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  52.45 
 
 		 746 aa  752    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  51.24 
 
 		 761 aa  712    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  51.81 
 
 		 788 aa  717    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  52.43 
 
 		 742 aa  747    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  100 
 
 		 723 aa  1470    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  51.77 
 
 		 742 aa  737    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  48.17 
 
 		 754 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  52.24 
 
 		 819 aa  744    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  54 
 
 		 834 aa  780    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  52.5 
 
 		 723 aa  726    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  48.07 
 
 		 771 aa  657    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  50.22 
 
 		 791 aa  634  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  46.92 
 
 		 754 aa  619  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  45.89 
 
 		 781 aa  555  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  44.49 
 
 		 769 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  42.22 
 
 		 771 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  39.94 
 
 		 752 aa  533  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  42.21 
 
 		 792 aa  529  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  38.93 
 
 		 752 aa  531  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  46.09 
 
 		 739 aa  528  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  41.81 
 
 		 782 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  44.31 
 
 		 727 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  50.51 
 
 		 543 aa  505  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  42.36 
 
 		 785 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  40.14 
 
 		 786 aa  501  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  42.32 
 
 		 914 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  44.66 
 
 		 639 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  43.85 
 
 		 612 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  44.52 
 
 		 641 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  45.04 
 
 		 635 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  43.82 
 
 		 632 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  44.12 
 
 		 632 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  42.86 
 
 		 594 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  41.7 
 
 		 627 aa  429  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  41.7 
 
 		 627 aa  429  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  41.73 
 
 		 584 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  42.86 
 
 		 614 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  38.49 
 
 		 559 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  26.42 
 
 		 375 aa  109  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  45.28 
 
 		 176 aa  95.1  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  27.36 
 
 		 372 aa  88.6  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  24.83 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  24.83 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  24.83 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  25.74 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  25 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.1 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.69 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2455  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  21.58 
 
 		 530 aa  54.3  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0114  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.5 
 
 		 357 aa  54.3  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.292099  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2485  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 		 363 aa  51.6  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0293375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2385  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  21.99 
 
 		 358 aa  50.8  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.767924  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0991  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  21.25 
 
 		 464 aa  50.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0497  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  21.2 
 
 		 364 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3255  hypothetical protein  28.96 
 
 		 309 aa  49.3  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0629  alpha/beta hydrolase fold protein  21.29 
 
 		 368 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0781  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  21.05 
 
 		 368 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2400  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.19 
 
 		 376 aa  47  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.661359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5780  alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 		 369 aa  45.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.390306  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2415  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  23.65 
 
 		 355 aa  44.3  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00432612  normal  0.509875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>