71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2708 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3001  hypothetical protein  53.7 
 
 		 723 aa  767    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3450  hypothetical protein  48.47 
 
 		 834 aa  672    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602326  normal  0.893374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0756  hypothetical protein  51.34 
 
 		 819 aa  707    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0627  hypothetical protein  50.14 
 
 		 791 aa  688    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5747  hypothetical protein  50.77 
 
 		 742 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0202  hypothetical protein  58.66 
 
 		 788 aa  894    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.547109  normal  0.0909851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2452  hypothetical protein  53.76 
 
 		 746 aa  764    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3684  hypothetical protein  50.48 
 
 		 761 aa  691    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716907  normal  0.451061 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1557  putative poly(3-hydroxyalkanoate) synthetase  48.07 
 
 		 723 aa  681    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0863  hypothetical protein  52.93 
 
 		 742 aa  752    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0564  hypothetical protein  52.27 
 
 		 754 aa  719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2708  hypothetical protein  100 
 
 		 771 aa  1563    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3205  hypothetical protein  46.04 
 
 		 754 aa  627  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2100  hypothetical protein  42.78 
 
 		 752 aa  580  1e-164  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2089  hypothetical protein  42.63 
 
 		 752 aa  573  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2976  hypothetical protein  42.54 
 
 		 792 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2635  hypothetical protein  43.18 
 
 		 782 aa  548  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.916362  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1201  hypothetical protein  47.53 
 
 		 771 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44010  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  51.27 
 
 		 727 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6911  hypothetical protein  42.39 
 
 		 781 aa  537  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2794  hypothetical protein  43.46 
 
 		 739 aa  535  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000769221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2654  hypothetical protein  39.53 
 
 		 785 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1566  hypothetical protein  41.84 
 
 		 769 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03910  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  43.96 
 
 		 914 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0371  hypothetical protein  39.74 
 
 		 786 aa  515  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3253  hypothetical protein  47.45 
 
 		 543 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.717956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2190  hypothetical protein  43.9 
 
 		 635 aa  456  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4838  hypothetical protein  45.01 
 
 		 641 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154027  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2709  hypothetical protein  43.28 
 
 		 639 aa  450  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1083  hypothetical protein  43.22 
 
 		 594 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4586  hypothetical protein  45.7 
 
 		 632 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.409172  normal  0.67715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1470  hypothetical protein  42.33 
 
 		 612 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5298  hypothetical protein  44.44 
 
 		 627 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4907  hypothetical protein  41.92 
 
 		 632 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1658  hypothetical protein  44.44 
 
 		 627 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0197  hypothetical protein  42.26 
 
 		 584 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4527  hypothetical protein  42.13 
 
 		 614 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0232774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2348  hypothetical protein  41.92 
 
 		 559 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3197  response regulator receiver protein  45.79 
 
 		 176 aa  100  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27080  PHB de-polymerase  28.43 
 
 		 372 aa  94.4  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751136  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1145  hypothetical protein  27.92 
 
 		 375 aa  92.8  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3496  PHB de-polymerase-like  27.21 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270414  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4870  PHB de-polymerase domain-containing protein  27.21 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5416  PHB de-polymerase domain-containing protein  27.21 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2149  PHB de-polymerase domain protein  28.51 
 
 		 381 aa  76.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2197  PHB de-polymerase domain-containing protein  23.91 
 
 		 375 aa  73.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  22.86 
 
 		 464 aa  57  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3255  hypothetical protein  28.35 
 
 		 309 aa  54.7  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0781  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.6 
 
 		 368 aa  50.8  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2385  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  29.07 
 
 		 358 aa  50.8  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.767924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0497  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24.27 
 
 		 364 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0114  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  21.45 
 
 		 357 aa  47.8  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.292099  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2415  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  24 
 
 		 355 aa  47.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00432612  normal  0.509875 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1671  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  26.4 
 
 		 572 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0635896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6027  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  27.88 
 
 		 597 aa  46.6  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.436418  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5071  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  26.92 
 
 		 613 aa  46.6  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0125848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4057  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.34 
 
 		 366 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.588207  normal  0.251986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2400  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.67 
 
 		 376 aa  45.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.661359 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2331  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  28.32 
 
 		 660 aa  45.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121223  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23630  PHB synthase  26.61 
 
 		 567 aa  45.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1588  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  30.09 
 
 		 597 aa  45.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0109176 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2255  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  28.44 
 
 		 656 aa  44.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.164644  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1509  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  25.93 
 
 		 677 aa  44.7  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.321101  normal  0.417915 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2166  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase  28.32 
 
 		 599 aa  44.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1322  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  28.44 
 
 		 632 aa  44.7  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.052712  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1082  poly-beta-hydroxybutyrate polymerase  28.44 
 
 		 604 aa  44.3  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1811  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  28.44 
 
 		 604 aa  44.3  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0777167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0085  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  28.44 
 
 		 604 aa  44.3  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2485  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 		 363 aa  44.3  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0293375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2203  Poly-beta-hydroxybutyrate polymerase  28.44 
 
 		 604 aa  44.3  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.384806  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1916  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  29.2 
 
 		 597 aa  44.3  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.0385848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>