More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3135 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3135  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 167 aa  349  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.457152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000703  methionine sulfoxide reductase  64.63 
 
 		 157 aa  227  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06586  methionine sulfoxide reductase A  62.87 
 
 		 160 aa  227  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2638  methionine sulfoxide reductase A  63.19 
 
 		 173 aa  215  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00490815  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2272  methionine sulfoxide reductase A  53.89 
 
 		 159 aa  192  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2684  methionine sulfoxide reductase A  49.4 
 
 		 158 aa  174  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2741  methionine sulfoxide reductase A  49.4 
 
 		 158 aa  174  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  39.41 
 
 		 337 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  40.46 
 
 		 359 aa  124  5e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  39.66 
 
 		 364 aa  124  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0556  peptide methionine sulfoxide reductase  42.14 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  39.64 
 
 		 346 aa  120  9e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  33.92 
 
 		 405 aa  120  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  37.89 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  38.73 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  37.72 
 
 		 348 aa  118  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  37.72 
 
 		 317 aa  117  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0740  peptide methionine sulfoxide reductase  41.77 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.800973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2591  methionine sulfoxide reductase A  40.85 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  37.82 
 
 		 316 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  35.76 
 
 		 332 aa  115  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  37.27 
 
 		 735 aa  115  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2913  methionine sulfoxide reductase A  40.24 
 
 		 157 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.169156  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  36.53 
 
 		 385 aa  114  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  39.05 
 
 		 352 aa  114  7.999999999999999e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl050  methionine sulfoxide reductase A  39.13 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  37.8 
 
 		 590 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  37.28 
 
 		 368 aa  111  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0286  methionine sulfoxide reductase A  34.13 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  34.97 
 
 		 611 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1687  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  38.04 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  37.27 
 
 		 309 aa  106  2e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  33.77 
 
 		 311 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  38.04 
 
 		 329 aa  105  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  36.54 
 
 		 172 aa  104  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1002  methionine sulfoxide reductase A  33.75 
 
 		 167 aa  103  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  33.76 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  33.76 
 
 		 173 aa  101  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2259  peptide methionine sulfoxide reductase  33.13 
 
 		 177 aa  101  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00118582  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  34.18 
 
 		 178 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  34.18 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4210  peptide methionine sulfoxide reductase  32.48 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  34.62 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2804  methionine sulfoxide reductase A  33.12 
 
 		 171 aa  98.6  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.961947  normal  0.595065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  30.97 
 
 		 167 aa  99  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  33.33 
 
 		 169 aa  98.2  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1502  peptide methionine sulfoxide reductase  35.4 
 
 		 166 aa  98.2  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.859689  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  38.04 
 
 		 309 aa  97.8  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4325  methionine sulfoxide reductase A  32.7 
 
 		 166 aa  97.8  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  32.5 
 
 		 168 aa  97.4  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  33.54 
 
 		 322 aa  97.8  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5471  methionine sulfoxide reductase A  33.99 
 
 		 171 aa  97.4  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  33.12 
 
 		 168 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3069  methionine sulfoxide reductase A  32.91 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106542  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1105  methionine sulfoxide reductase A  33.33 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.783712 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  33.99 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  33.99 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  33.99 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6581  methionine sulfoxide reductase A  32.69 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126192  normal  0.186636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5709  methionine sulfoxide reductase A  33.33 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  34.16 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf807  peptide methionine sulfoxide reductase A  34.57 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  33.33 
 
 		 170 aa  95.9  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3737  methionine sulfoxide reductase A  32.05 
 
 		 175 aa  95.5  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4156  methionine sulfoxide reductase A  30.82 
 
 		 168 aa  95.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2142  methionine sulfoxide reductase A  33.33 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856745  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  32.69 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  32.05 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  35.85 
 
 		 183 aa  94  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  31.97 
 
 		 178 aa  94  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6171  methionine sulfoxide reductase A  32.05 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.581764  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0870  methionine sulfoxide reductase A  33.76 
 
 		 177 aa  93.6  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  33.12 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  32.48 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  32.73 
 
 		 179 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0327  peptide methionine sulfoxide reductase  32.72 
 
 		 446 aa  92  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.445672  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  29.56 
 
 		 178 aa  91.7  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  28.66 
 
 		 238 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  30.63 
 
 		 165 aa  91.3  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6406  methionine sulfoxide reductase A  31.21 
 
 		 168 aa  91.3  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0595375  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10138  methionine sulfoxide reductase A  32.89 
 
 		 182 aa  91.3  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0467  peptide methionine sulfoxide reductase  27.45 
 
 		 245 aa  90.5  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000919967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  32.45 
 
 		 176 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  31.06 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00119018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  31.82 
 
 		 236 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  31.87 
 
 		 220 aa  90.1  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  32.24 
 
 		 220 aa  90.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  27.85 
 
 		 212 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  32.5 
 
 		 180 aa  90.1  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1656  peptide methionine sulfoxide reductase  32.17 
 
 		 225 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4424  peptide methionine sulfoxide reductase  31.87 
 
 		 223 aa  89.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00185603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  30.63 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  31.45 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  31.87 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  31.45 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  31.01 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2923  peptide methionine sulfoxide reductase  32.28 
 
 		 191 aa  88.6  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  33.96 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4772  methionine sulfoxide reductase A  32 
 
 		 212 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1694  peptide methionine sulfoxide reductase  31.13 
 
 		 239 aa  89  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>