More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50313 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_50313  plastidic transaldolase  100 
 
 		 399 aa  824    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03321  transaldolase B  45.75 
 
 		 319 aa  285  8e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28222  transaldolase  46.18 
 
 		 316 aa  278  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562417  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1655  transaldolase B  47.18 
 
 		 316 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000243642  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4104  transaldolase B  46.22 
 
 		 320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.559408  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3234  transaldolase B  45.13 
 
 		 324 aa  274  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0007  transaldolase B  44.97 
 
 		 317 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0007  transaldolase B  44.67 
 
 		 317 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0007  transaldolase B  44.67 
 
 		 317 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0007  transaldolase B  44.67 
 
 		 317 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111561  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0007  transaldolase B  44.67 
 
 		 317 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.811187  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3588  transaldolase  44.38 
 
 		 317 aa  266  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0008  transaldolase B  44.38 
 
 		 317 aa  266  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0007  transaldolase B  44.38 
 
 		 338 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00008  transaldolase B  44.38 
 
 		 317 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00008  hypothetical protein  44.38 
 
 		 317 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0009  transaldolase B  44.38 
 
 		 338 aa  266  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.703316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0009  transaldolase B  44.38 
 
 		 317 aa  266  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.967516  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3647  transaldolase B  44.38 
 
 		 317 aa  266  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0008  transaldolase B  44.38 
 
 		 317 aa  266  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3664  transaldolase B  43.79 
 
 		 317 aa  262  6e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3859  transaldolase B  43.49 
 
 		 317 aa  260  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0913  transaldolase B  43.66 
 
 		 317 aa  260  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.507004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2054  transaldolase B  43.82 
 
 		 319 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.4803  normal  0.221848 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0537  transaldolase B  44.38 
 
 		 317 aa  259  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1919  transaldolase B  43.32 
 
 		 321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0576  transaldolase B  44.08 
 
 		 317 aa  258  9e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0570  transaldolase B  43.2 
 
 		 317 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2734  transaldolase B  43.49 
 
 		 317 aa  258  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145141  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3546  transaldolase B  43.53 
 
 		 318 aa  256  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02355  transaldolase A  43.27 
 
 		 316 aa  255  8e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1206  transaldolase  43.27 
 
 		 316 aa  255  8e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2742  transaldolase A  43.27 
 
 		 316 aa  255  8e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02317  hypothetical protein  43.27 
 
 		 316 aa  255  8e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1213  transaldolase A  43.27 
 
 		 316 aa  255  8e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2593  transaldolase A  43.27 
 
 		 316 aa  255  8e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2610  transaldolase A  43.27 
 
 		 316 aa  255  8e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3685  transaldolase A  43.27 
 
 		 316 aa  255  8e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0521  transaldolase B  43.02 
 
 		 316 aa  255  9e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2967  transaldolase B  43.53 
 
 		 318 aa  255  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000461015  normal  0.264438 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1049  transaldolase B  43.07 
 
 		 318 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0982  transaldolase A  44.12 
 
 		 316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2830  transaldolase A  43.27 
 
 		 316 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0688  transaldolase B  42.31 
 
 		 317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0573478  hitchhiker  0.00205888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3472  transaldolase B  42.31 
 
 		 317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179148  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3622  transaldolase B  44.48 
 
 		 317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3599  transaldolase B  42.31 
 
 		 317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83514  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0803  transaldolase B  42.31 
 
 		 317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240224  normal  0.311976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3049  transaldolase B  43.24 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00546599  normal  0.166064 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0746  transaldolase A  43.24 
 
 		 316 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2959  transaldolase A  42.9 
 
 		 316 aa  253  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.874274 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1089  transaldolase B  43.98 
 
 		 318 aa  252  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675704  normal  0.0360442 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1044  transaldolase B  43.36 
 
 		 318 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265536  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2900  transaldolase B  43.24 
 
 		 317 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1074  transaldolase B  43.7 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0076  transaldolase A  41.18 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3147  transaldolase B  43.24 
 
 		 318 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000170325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1280  transaldolase B  43.95 
 
 		 318 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000101503  normal  0.0282739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3245  transaldolase B  43.2 
 
 		 318 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000112094  decreased coverage  0.000667795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0822  transaldolase B  43.84 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.128995 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1111  transaldolase B  43.2 
 
 		 318 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000240039  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0086  transaldolase B  42.94 
 
 		 316 aa  250  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.946439  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0564  transaldolase B  41.94 
 
 		 316 aa  249  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2069  transaldolase B  43.06 
 
 		 318 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1145  transaldolase B  42.9 
 
 		 318 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000154463  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1185  transaldolase B  43.99 
 
 		 318 aa  249  8e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0507197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1485  transaldolase B  44.07 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000365093  normal  0.591576 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0204  transaldolase B  41.4 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3806  transaldolase B  42.23 
 
 		 326 aa  246  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.390141 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3736  transaldolase B  42.61 
 
 		 321 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2119  transaldolase  43.95 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06256  transaldolase B  42.4 
 
 		 316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22140  transaldolase B  43.02 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3479  transaldolase A  42.35 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.272335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0519  transaldolase B  41.54 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.882158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27340  transaldolase B  43.02 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2666  transaldolase A  40.56 
 
 		 316 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3850  transaldolase B  44.71 
 
 		 318 aa  242  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866528  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2839  transaldolase A  40.56 
 
 		 316 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1914  transaldolase B  42.98 
 
 		 313 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163672 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2732  transaldolase A  40.56 
 
 		 316 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1685  transaldolase B  42.69 
 
 		 308 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1931  transaldolase B  44.12 
 
 		 308 aa  243  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.247297 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3437  transaldolase B  43.06 
 
 		 321 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2617  transaldolase A  40.28 
 
 		 316 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2706  transaldolase A  40.28 
 
 		 316 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1709  transaldolase B  43.24 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137258  hitchhiker  0.0000213936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2089  transaldolase B  42.82 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.466177  normal  0.339985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2168  transaldolase B  42.77 
 
 		 308 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0705  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  41.94 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0775  transaldolase B  42.57 
 
 		 318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.38826  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2514  transaldolase B  42.73 
 
 		 316 aa  239  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.38793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0700  transaldolase A  43.11 
 
 		 315 aa  239  5.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07571  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  42.01 
 
 		 390 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05751  transaldolase B  39.82 
 
 		 333 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2149  transaldolase A  41.07 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3574  transaldolase B  42.77 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000494  transaldolase  41.81 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.237649  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0587  transaldolase B  39.88 
 
 		 327 aa  238  2e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1424  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  41.76 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>