More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5208 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5208  response regulator receiver protein  100 
 
 		 184 aa  373  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000457636 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3207  response regulator receiver protein  70.97 
 
 		 186 aa  263  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2889  response regulator receiver protein  70.43 
 
 		 186 aa  263  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2198  response regulator receiver protein  60 
 
 		 192 aa  228  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3005  response regulator receiver domain-containing protein  55.92 
 
 		 212 aa  223  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4374  response regulator receiver protein  59.56 
 
 		 174 aa  216  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.45297 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3494  response regulator receiver protein  61.75 
 
 		 180 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.342019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1110  response regulator receiver domain-containing protein  49.18 
 
 		 208 aa  190  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00277439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1942  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 280 aa  84.3  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  30.89 
 
 		 1172 aa  82.8  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.86 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2281  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.217898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  30.77 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.29 
 
 		 1180 aa  76.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.09 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3844  response regulator receiver domain-containing protein  32.03 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 120 aa  77  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  27.86 
 
 		 1156 aa  75.9  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.03 
 
 		 434 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1436  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.777113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.03 
 
 		 434 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2427  response regulator receiver protein  28 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.468058 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3907  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.71 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0184  response regulator receiver protein  31.76 
 
 		 302 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2157  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  30.72 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  31.9 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2370  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 414 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0751  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 485 aa  74.7  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0880271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3596  two component transcriptional regulator  30.71 
 
 		 230 aa  74.3  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  30.77 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  30.77 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  29.77 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  30.58 
 
 		 123 aa  73.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3985  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 121 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.58 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  30.89 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  24.18 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0599  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 123 aa  73.6  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.44338  hitchhiker  0.0000000000672903 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.61 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  28.83 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.75 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.33 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.51 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 121 aa  72  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  30.36 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3728  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 124 aa  72  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  28.48 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0541  two component transcriptional regulator  30.4 
 
 		 230 aa  72  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.94 
 
 		 226 aa  72  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4173  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 126 aa  72  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  29.75 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 		 721 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  29.37 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  31.54 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  26.45 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  29.2 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  27.56 
 
 		 231 aa  70.9  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.45 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4451  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.38 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 120 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2174  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  30.17 
 
 		 134 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5610  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  27.34 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 125 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 132 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  27.33 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1745  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 126 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 544 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  28 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.88 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  26.56 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.04 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0804  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.12 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.504991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2426  DNA-binding response regulator  33.59 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3468  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2262  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  29.01 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  29.69 
 
 		 1629 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  26.74 
 
 		 1306 aa  69.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4115  response regulator receiver protein  27.22 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  26.92 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0905  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000245258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.11 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0870  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.226165  normal  0.635424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0435  response regulator receiver protein  31.48 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>