More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3494 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3494  response regulator receiver protein  100 
 
 		 180 aa  358  3e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.342019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5208  response regulator receiver protein  61.75 
 
 		 184 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000457636 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4374  response regulator receiver protein  60.11 
 
 		 174 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.45297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2889  response regulator receiver protein  58.06 
 
 		 186 aa  204  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3207  response regulator receiver protein  58.06 
 
 		 186 aa  204  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2198  response regulator receiver protein  55.79 
 
 		 192 aa  197  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3005  response regulator receiver domain-containing protein  49.29 
 
 		 212 aa  185  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1110  response regulator receiver domain-containing protein  50.57 
 
 		 208 aa  175  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00277439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1942  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2281  response regulator receiver protein  29.77 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.217898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  37.5 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  33.08 
 
 		 1156 aa  80.9  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.26 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  34.85 
 
 		 1180 aa  79.7  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  34.17 
 
 		 1172 aa  79.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.87 
 
 		 1131 aa  79  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 394 aa  77.8  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 340 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 121 aa  77.4  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  29.58 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 134 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  27.07 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  33.62 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0065  response regulator receiver domain-containing protein  35.65 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670969  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  34.71 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.4 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  31.03 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  31.16 
 
 		 229 aa  74.3  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.88 
 
 		 1514 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1208  phosphate regulon response regulator PhoB  36.21 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  28.93 
 
 		 121 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  33.06 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.59 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  30.16 
 
 		 131 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.17 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0978  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000299391  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.88 
 
 		 1514 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0435  response regulator receiver protein  33.8 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  34.03 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 		 1651 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  30.71 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1436  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.777113  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 1383 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.76 
 
 		 589 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 124 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.13 
 
 		 237 aa  72  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 122 aa  72  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 137 aa  72  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  32.48 
 
 		 224 aa  72  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.37 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 127 aa  72  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.89 
 
 		 434 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  27.82 
 
 		 919 aa  71.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0508  twitching motility protein PilG  32.23 
 
 		 135 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.38 
 
 		 350 aa  71.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05320  twitching motility protein PilG  32.23 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.89 
 
 		 434 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.58 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1538  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  30.37 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.280381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  30 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2262  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 281 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  27.41 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3365  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.648544 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  26.72 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1136  response regulator receiver domain-containing protein  34.45 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3461  response regulator receiver  29.14 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  26.88 
 
 		 1299 aa  71.2  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.58 
 
 		 226 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3354  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.97 
 
 		 318 aa  70.9  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1556  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25 
 
 		 300 aa  70.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  31.3 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 		 226 aa  70.9  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 		 870 aa  70.9  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3971  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 145 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  28.37 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.16 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  28.99 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 120 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 133 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 122 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.16 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>