More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4173 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4173  response regulator receiver protein  100 
 
 		 126 aa  252  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2384  response regulator receiver protein  66.39 
 
 		 123 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1834  response regulator receiver protein  66.39 
 
 		 123 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00302805 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1641  response regulator receiver protein  62.5 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1967  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.1 
 
 		 310 aa  94.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 228 aa  90.9  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 236 aa  90.5  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  42.74 
 
 		 229 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  42.74 
 
 		 229 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.74 
 
 		 229 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 225 aa  89.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  38.21 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 236 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  42.74 
 
 		 229 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 		 236 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 231 aa  89.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  40.16 
 
 		 225 aa  89  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  42.98 
 
 		 234 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 234 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 229 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  42.97 
 
 		 242 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  39.67 
 
 		 234 aa  88.6  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  42.97 
 
 		 229 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  42.97 
 
 		 229 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  41.13 
 
 		 229 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 238 aa  87.8  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 229 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 229 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3838  response regulator receiver domain-containing protein  41.94 
 
 		 234 aa  87.8  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000539223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  38.1 
 
 		 231 aa  87.4  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  42.5 
 
 		 239 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  42.5 
 
 		 239 aa  87.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  42.5 
 
 		 239 aa  87.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  42.5 
 
 		 239 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  42.5 
 
 		 239 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  42.5 
 
 		 239 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  42.5 
 
 		 239 aa  87.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 239 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  42.5 
 
 		 239 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  42.5 
 
 		 239 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3596  two component transcriptional regulator  39.68 
 
 		 230 aa  87  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 235 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.67 
 
 		 227 aa  86.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.84 
 
 		 212 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 231 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.97 
 
 		 1180 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 229 aa  85.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  38.1 
 
 		 231 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  40 
 
 		 317 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 236 aa  84.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  34.71 
 
 		 235 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 250 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  84.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.5 
 
 		 230 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1930  two component transcriptional regulator  40.32 
 
 		 233 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.465475  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 229 aa  84.3  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.65 
 
 		 228 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  35.54 
 
 		 231 aa  84  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1434  DNA-binding response regulator PhoB  35 
 
 		 243 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 243 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.4 
 
 		 231 aa  83.6  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 		 233 aa  83.6  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  37.01 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.3 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  40.34 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0660  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  40.5 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  39.5 
 
 		 243 aa  81.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  34.71 
 
 		 1156 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  38.84 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  37.7 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 223 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 227 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.52 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 247 aa  81.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  38.89 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 235 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  39.52 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  42.62 
 
 		 290 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  38.89 
 
 		 232 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 223 aa  81.3  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  36.89 
 
 		 234 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2476  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 227 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210757  normal  0.512741 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 		 249 aa  81.3  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 231 aa  81.3  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  35.48 
 
 		 224 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.92 
 
 		 1131 aa  80.9  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>