More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1967 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1967  response regulator receiver protein  100 
 
 		 138 aa  282  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4173  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1834  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 123 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00302805 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2384  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 123 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1641  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0674  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0682036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  33.9 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 2539 aa  77.8  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 2423 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0776  response regulator receiver domain-containing protein  31.97 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0195762  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0641  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  32.48 
 
 		 1987 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0650  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44923  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0616  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.262604  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  30.56 
 
 		 2458 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  30.61 
 
 		 2476 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0161  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.48 
 
 		 1992 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2174  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.17 
 
 		 474 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3220  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 		 233 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.975965  hitchhiker  0.00188513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0660  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  30.58 
 
 		 248 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0710  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  32.48 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.23 
 
 		 1971 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  36.43 
 
 		 2284 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0075  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  31.03 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.124346  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  30.53 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 579 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 1629 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 1832 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3899  response regulator receiver  32.79 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.71 
 
 		 2336 aa  70.9  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  35.59 
 
 		 2301 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0460  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.31 
 
 		 835 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.980587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  34.17 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.33 
 
 		 337 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0722  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  30.58 
 
 		 240 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.84817e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 1646 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 1646 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2552  response regulator receiver domain-containing protein  31.15 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 1647 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 564 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1436  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.777113  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1818  two component reponse regulator  31.62 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  27.73 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4626  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3907  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  30.08 
 
 		 631 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  34.45 
 
 		 1156 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  27.73 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0058  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  29.31 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000220235 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  29.41 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 531 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  32.48 
 
 		 1296 aa  68.2  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3985  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1352  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 410 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  30.77 
 
 		 2070 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 1160 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.61 
 
 		 772 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2623  response regulator receiver  31.36 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  27.35 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2101  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 126 aa  67  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.88 
 
 		 1131 aa  67.4  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  30.83 
 
 		 650 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  27.35 
 
 		 161 aa  67  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  31.3 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 1758 aa  67  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0828  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000089442  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3578  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.677729  normal  0.0425656 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3688  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 123 aa  67  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3844  response regulator receiver domain-containing protein  32.2 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3136  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.28 
 
 		 919 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0718  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01227  two-component hybrid sensor and regulator  31.36 
 
 		 699 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 1356 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>