261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_15221 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_15221  DNA photolyase-like protein  100 
 
 
378 aa  761    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.408051  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15621  DNA photolyase-like protein  67.99 
 
 
384 aa  537  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.299984  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15471  DNA photolyase-like protein  67.72 
 
 
382 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.111669  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1458  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  67.72 
 
 
384 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.89887  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15661  DNA photolyase-like protein  40.37 
 
 
371 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.675982  normal  0.652082 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0728  putative DNA photolyase  38.89 
 
 
371 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.947552  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3370  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  36.05 
 
 
410 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1389  putative deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.86 
 
 
405 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359515  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2809  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  34.12 
 
 
403 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29652  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0617  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  32.21 
 
 
396 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.07426  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4249  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  35.26 
 
 
270 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1867  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  34.2 
 
 
293 aa  102  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107933  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0011  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  32.68 
 
 
270 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.161683  normal  0.149093 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1589  DNA photolyase FAD-binding  30.05 
 
 
271 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0218  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  31.5 
 
 
303 aa  99  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0245  deoxyribodipyrimidine photolyase  30 
 
 
298 aa  97.1  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.51093  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0940  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  33.33 
 
 
278 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4270  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.47 
 
 
473 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397965  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1249  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  26.36 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252669 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1151  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.61 
 
 
452 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25 
 
 
454 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0151  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.38 
 
 
497 aa  80.1  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0953516  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1611  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.63 
 
 
445 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0715  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.91 
 
 
457 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.721475  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0731  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.91 
 
 
457 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  27.8 
 
 
476 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3180  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  27.8 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0349  deoxyribodipyrimidine photolyase, putative  27.19 
 
 
457 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.723156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2935  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.64 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3187  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  28.64 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  25.35 
 
 
468 aa  77  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.46 
 
 
479 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  23.51 
 
 
481 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4047  Deoxyribodipyrimidine photolyase-like  26.69 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00445605  normal  0.106433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4086  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  21.9 
 
 
449 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2919  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.96 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.22 
 
 
492 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2469  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.37 
 
 
475 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205711 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0288  DNA photolyase FAD-binding  23.94 
 
 
465 aa  73.2  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.155544  normal  0.119697 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2075  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  26.52 
 
 
476 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1224  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.78 
 
 
497 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5309  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.49 
 
 
477 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4704  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.65 
 
 
459 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.940834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1272  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.75 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1166  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.32 
 
 
493 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3030  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.63 
 
 
451 aa  70.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.334621  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0529  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.5 
 
 
421 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0312273  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0739  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.11 
 
 
480 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3384  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.8 
 
 
512 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4450  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.39 
 
 
480 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2125  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.71 
 
 
479 aa  70.1  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2179  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.82 
 
 
481 aa  70.5  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1252  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.08 
 
 
476 aa  70.5  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0460072  normal  0.903658 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  24.68 
 
 
471 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1236  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.32 
 
 
493 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2747  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.49 
 
 
474 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00995843  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0080  deoxyribodipyrimidine photolyase, cyclobutane pyrimidine dimer-specific  24.06 
 
 
469 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000198558  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0767  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.39 
 
 
475 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2838  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.22 
 
 
497 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.182548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61640  deoxyribodipyrimidine photolyase  25 
 
 
481 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0940349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.63 
 
 
487 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1165  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.1 
 
 
493 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  24.26 
 
 
471 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.32 
 
 
483 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.54 
 
 
486 aa  69.3  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3193  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  29.15 
 
 
476 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2244  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.97 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.590626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2257  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.44 
 
 
442 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3184  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  26.63 
 
 
476 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1215  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.89 
 
 
477 aa  68.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.300983  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4736  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.88 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001252  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.63 
 
 
471 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553687  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3098  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.51 
 
 
487 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.383524  normal  0.0341678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  24.1 
 
 
474 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  25.22 
 
 
476 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2714  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.04 
 
 
493 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0866  deoxyribodipyrimidine photo-lyase (photoreactivating enzyme)  25.62 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.91 
 
 
477 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0778  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  23.78 
 
 
453 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2777  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25 
 
 
469 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05122  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.67 
 
 
471 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3356  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.77 
 
 
483 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617341  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1623  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.23 
 
 
482 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2021  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  22.61 
 
 
445 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1122  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.55 
 
 
457 aa  67  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000025981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0729  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.75 
 
 
483 aa  67  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1383  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.71 
 
 
436 aa  67  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0135788  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  22.61 
 
 
445 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2084  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  22.61 
 
 
445 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1604  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.47 
 
 
486 aa  67  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1444  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.34 
 
 
483 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.14 
 
 
484 aa  66.6  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.84 
 
 
477 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1302  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.63 
 
 
456 aa  66.2  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.674491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1309  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.34 
 
 
499 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0723  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.22 
 
 
472 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.867142 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3586  deoxyribodipyrimidine photolyase  22.61 
 
 
487 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1112  deoxyribodipyrimidine photolyase  22.61 
 
 
487 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3054  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.34 
 
 
505 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.746759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>