261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0728 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0728  putative DNA photolyase  100 
 
 		 371 aa  753    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.947552  n/a   
 
 
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NC_008819  NATL1_15661  DNA photolyase-like protein  93.53 
 
 		 371 aa  687    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.675982  normal  0.652082 
 
 
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NC_009091  P9301_15471  DNA photolyase-like protein  40.37 
 
 		 382 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.111669  n/a   
 
 
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NC_008816  A9601_15621  DNA photolyase-like protein  40.11 
 
 		 384 aa  279  6e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.299984  n/a   
 
 
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NC_007577  PMT9312_1458  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  41.44 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.89887  n/a   
 
 
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NC_008817  P9515_15221  DNA photolyase-like protein  39.72 
 
 		 378 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.408051  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_1389  putative deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.33 
 
 		 405 aa  216  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359515  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_0617  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  32.89 
 
 		 396 aa  209  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.07426  n/a   
 
 
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NC_008043  TM1040_3370  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  30.95 
 
 		 410 aa  202  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.455231 
 
 
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NC_007802  Jann_2809  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  34.31 
 
 		 403 aa  196  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29652  normal  1 
 
 
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NC_009767  Rcas_4249  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  34.41 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_1867  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  36.31 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0940  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  35.83 
 
 		 278 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0011  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  33.33 
 
 		 270 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.161683  normal  0.149093 
 
 
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NC_011831  Cagg_1589  DNA photolyase FAD-binding  33.71 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007513  Syncc9902_0245  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.26 
 
 		 298 aa  103  7e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.51093  n/a   
 
 
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NC_007516  Syncc9605_0218  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  31.72 
 
 		 303 aa  101  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_2257  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.49 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_4086  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.96 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal  0.759953 
 
 
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NC_009077  Mjls_2021  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.11 
 
 		 445 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.128536 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.11 
 
 		 445 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2084  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.11 
 
 		 445 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.606959 
 
 
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NC_013093  Amir_0529  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.89 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0312273  n/a   
 
 
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NC_007575  Suden_1611  deoxyribodipyrimidine photolyase  46.84 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.89 
 
 		 454 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4450  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.78 
 
 		 480 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_1249  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  28.26 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252669 
 
 
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NC_008463  PA14_61640  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.55 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0940349 
 
 
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NC_009656  PSPA7_5309  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.53 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3193  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  41.41 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_0739  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.89 
 
 		 480 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_3184  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  41.57 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
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NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  29.44 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  29.44 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013512  Sdel_1151  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.59 
 
 		 452 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  27.21 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.1 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_2244  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.42 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.590626 
 
 
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NC_007492  Pfl01_4736  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.87 
 
 		 488 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
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NC_008340  Mlg_2256  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  26.74 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.786952  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_0778  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.72 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_1380  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.5 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866986  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_0780  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.9 
 
 		 475 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431367  normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  40.45 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2935  deoxyribodipyrimidine photolyase  40.45 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  24.74 
 
 		 468 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_1383  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.24 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0135788  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0723  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.32 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.867142 
 
 
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NC_007530  GBAA_3180  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  40.45 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2075  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  41.18 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_3030  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.11 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.334621  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.37 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_3187  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  40.45 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.13 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.040956 
 
 
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NC_013441  Gbro_1272  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.46 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_1134  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.62 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172014  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_3384  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.27 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1224  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.02 
 
 		 497 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_00668  deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD-binding  25.79 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.86 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010468  EcolC_2947  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.79 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0625  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.79 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00657  hypothetical protein  25.79 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_0798  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.79 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0733  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.79 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_1386  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.46 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0285292 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03651  putative DNA photolyase  30 
 
 		 504 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305782  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1166  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.41 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_4704  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.05 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.940834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0756  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.4 
 
 		 473 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.645703  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0767  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.89 
 
 		 475 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1165  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  26.9 
 
 		 493 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1236  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  26.9 
 
 		 493 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0151  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.81 
 
 		 497 aa  72.8  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0953516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.35 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1212  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.19 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.0350184 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.94 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.94 
 
 		 481 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2928  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.26 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1302  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.09 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.674491  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0831  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.87 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.31293  hitchhiker  0.0019608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1376  deoxyribodipyrimidine photolyase  22.87 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0755  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.26 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.391934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0866  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.87 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.25 
 
 		 487 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1122  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.31 
 
 		 457 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000025981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10630  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  41.03 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0877345 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0080  deoxyribodipyrimidine photolyase, cyclobutane pyrimidine dimer-specific  24.37 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000198558  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.49 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0465  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.54 
 
 		 541 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4270  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.32 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397965  normal  0.444789 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0769  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.68 
 
 		 473 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.568717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3349  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.62 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0817  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.68 
 
 		 473 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_2179  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.87 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011313  VSAL_II0866  deoxyribodipyrimidine photo-lyase (photoreactivating enzyme)  27.42 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_3211  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.38 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.941968 
 
 
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NC_009665  Shew185_3068  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.75 
 
 		 500 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_0731  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.65 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_0715  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.65 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.721475  n/a   
 
 
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