295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4249 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4249  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  100 
 
 
270 aa  553  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0011  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  87.41 
 
 
270 aa  488  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.161683  normal  0.149093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0940  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  66.29 
 
 
278 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1867  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  62.21 
 
 
293 aa  347  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107933  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0218  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  61.45 
 
 
303 aa  341  7e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0245  deoxyribodipyrimidine photolyase  56.49 
 
 
298 aa  331  8e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.51093  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1589  DNA photolyase FAD-binding  49.81 
 
 
271 aa  246  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1249  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  43.55 
 
 
420 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252669 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3370  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  41.94 
 
 
410 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2809  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  42.44 
 
 
403 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29652  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1389  putative deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.11 
 
 
405 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359515  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15471  DNA photolyase-like protein  36.17 
 
 
382 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.111669  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15621  DNA photolyase-like protein  35.64 
 
 
384 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.299984  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0617  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  37.37 
 
 
396 aa  112  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.07426  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1458  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  35.64 
 
 
384 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.89887  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15661  DNA photolyase-like protein  35.48 
 
 
371 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.675982  normal  0.652082 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0728  putative DNA photolyase  34.41 
 
 
371 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.947552  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15221  DNA photolyase-like protein  35.26 
 
 
378 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.408051  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4047  Deoxyribodipyrimidine photolyase-like  36.28 
 
 
371 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00445605  normal  0.106433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4658  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.23 
 
 
476 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0553081  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0439  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.3 
 
 
435 aa  97.4  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.82 
 
 
454 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0994  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.86 
 
 
462 aa  95.1  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3349  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.36 
 
 
477 aa  93.6  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355989  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0263  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34 
 
 
490 aa  93.2  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.82 
 
 
487 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5309  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.47 
 
 
477 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2305  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.31 
 
 
467 aa  91.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000471562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61640  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.57 
 
 
481 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0940349 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4676  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.03 
 
 
500 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499221 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0151  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.96 
 
 
497 aa  90.5  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0953516  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1262  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.81 
 
 
463 aa  89.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103305  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  35.45 
 
 
471 aa  89  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0241  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33 
 
 
492 aa  89  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  34.92 
 
 
471 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1376  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.33 
 
 
492 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.9 
 
 
463 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  33.18 
 
 
468 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.33 
 
 
477 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0704  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.6 
 
 
497 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.56 
 
 
481 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.96 
 
 
481 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4704  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.67 
 
 
459 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.940834 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.89 
 
 
469 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1380  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.48 
 
 
470 aa  86.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866986  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2838  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.71 
 
 
497 aa  86.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.182548  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4736  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.99 
 
 
488 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1623  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.67 
 
 
482 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1613  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.33 
 
 
425 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3384  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.82 
 
 
512 aa  85.5  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1165  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  29.27 
 
 
493 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.44 
 
 
481 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1236  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  29.27 
 
 
493 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1166  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  29.44 
 
 
493 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0811  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.4 
 
 
475 aa  85.5  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00387  DNA photolyase (Eurofung)  32.99 
 
 
567 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.892479  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.67 
 
 
479 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1611  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.33 
 
 
445 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1151  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.82 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1759  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.41 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0257219  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3963  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.32 
 
 
511 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000556996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.31 
 
 
486 aa  85.1  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.31 
 
 
477 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  33.73 
 
 
472 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1112  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.23 
 
 
487 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3586  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.23 
 
 
487 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3356  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.84 
 
 
483 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617341  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0998  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.18 
 
 
457 aa  84  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50142  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1163  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.23 
 
 
487 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3589  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.69 
 
 
483 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.77 
 
 
491 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0998  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.31 
 
 
453 aa  83.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0430  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.04 
 
 
541 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.81 
 
 
492 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1444  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.56 
 
 
483 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1479  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.97 
 
 
478 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3098  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.5 
 
 
487 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.383524  normal  0.0341678 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5899  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.33 
 
 
519 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0769953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2178  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.33 
 
 
519 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240707  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3694  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.82 
 
 
484 aa  83.2  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0465  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.47 
 
 
541 aa  82.8  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1272  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.77 
 
 
434 aa  82.8  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.04 
 
 
452 aa  82.4  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1577  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.49 
 
 
493 aa  82.4  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547552  normal  0.6563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0739  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.17 
 
 
480 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2747  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.26 
 
 
474 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00995843  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0276  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.89 
 
 
431 aa  82  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0731  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.07 
 
 
457 aa  82  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0465  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.96 
 
 
473 aa  82  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0715  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.07 
 
 
457 aa  82  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.721475  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.29 
 
 
482 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.43 
 
 
482 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0767  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.69 
 
 
475 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5488  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.85 
 
 
518 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009718  Fnod_1383  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.45 
 
 
436 aa  81.6  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0135788  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  35.24 
 
 
474 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_2021  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.51 
 
 
445 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128536 
 
 
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NC_008340  Mlg_2256  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.47 
 
 
479 aa  81.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.786952  normal 
 
 
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NC_008705  Mkms_2084  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.51 
 
 
445 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.606959 
 
 
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NC_008782  Ajs_1801  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.81 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
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