296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1589 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1589  DNA photolyase FAD-binding  100 
 
 
271 aa  560  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0218  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  56.71 
 
 
303 aa  265  5.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0245  deoxyribodipyrimidine photolyase  56.28 
 
 
298 aa  261  6e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.51093  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0011  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  49.43 
 
 
270 aa  248  8e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.161683  normal  0.149093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4249  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  49.81 
 
 
270 aa  246  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1867  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  48.85 
 
 
293 aa  241  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107933  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0940  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  45.8 
 
 
278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1249  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  43.64 
 
 
420 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252669 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3370  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  40.89 
 
 
410 aa  129  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4047  Deoxyribodipyrimidine photolyase-like  37.39 
 
 
371 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00445605  normal  0.106433 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1389  putative deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.21 
 
 
405 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359515  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2809  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  37.33 
 
 
403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29652  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0617  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  38 
 
 
396 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.07426  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15661  DNA photolyase-like protein  33.69 
 
 
371 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.675982  normal  0.652082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.33 
 
 
482 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0728  putative DNA photolyase  33.71 
 
 
371 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.947552  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.05 
 
 
482 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4270  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.7 
 
 
473 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397965  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5309  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.44 
 
 
477 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15621  DNA photolyase-like protein  30.09 
 
 
384 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.299984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61640  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.12 
 
 
481 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0940349 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15471  DNA photolyase-like protein  31 
 
 
382 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.111669  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15221  DNA photolyase-like protein  30.05 
 
 
378 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.408051  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  36.1 
 
 
474 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.41 
 
 
486 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4658  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.29 
 
 
476 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0553081  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.73 
 
 
477 aa  99  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.07 
 
 
454 aa  98.6  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1134  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.49 
 
 
477 aa  98.6  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172014  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  35.53 
 
 
468 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1458  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  29.95 
 
 
384 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.89887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.94 
 
 
479 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5849  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.53 
 
 
505 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4736  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.62 
 
 
488 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1989  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.27 
 
 
468 aa  96.3  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.382914  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0151  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.99 
 
 
497 aa  96.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0953516  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11303  deoxyribodipyrimidine photolyase-class I  34.18 
 
 
434 aa  96.3  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0465  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.93 
 
 
473 aa  96.3  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3589  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.21 
 
 
483 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2196  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.77 
 
 
519 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0998  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.44 
 
 
453 aa  95.9  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5899  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.07 
 
 
519 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0769953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2178  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.07 
 
 
519 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240707  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3030  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.63 
 
 
451 aa  95.1  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.334621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0715  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.14 
 
 
457 aa  95.1  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.721475  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0994  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.18 
 
 
462 aa  95.5  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0731  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.14 
 
 
457 aa  95.1  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0349  deoxyribodipyrimidine photolyase, putative  32.75 
 
 
457 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.723156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1252  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.19 
 
 
476 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0460072  normal  0.903658 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1604  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33 
 
 
486 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1613  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.24 
 
 
425 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.02 
 
 
452 aa  93.6  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4676  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.16 
 
 
500 aa  93.2  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499221 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5488  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.07 
 
 
518 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1166  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.64 
 
 
493 aa  92  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0739  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.18 
 
 
480 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  35.82 
 
 
471 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  35.82 
 
 
471 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2095  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.49 
 
 
500 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2305  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.98 
 
 
467 aa  91.3  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000471562  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1383  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.2 
 
 
436 aa  91.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0135788  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1491  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.67 
 
 
499 aa  91.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.675954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4333  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.97 
 
 
435 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1380  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.66 
 
 
470 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866986  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3384  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.63 
 
 
512 aa  90.9  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1151  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.55 
 
 
452 aa  90.9  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1165  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.18 
 
 
493 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1236  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.18 
 
 
493 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2217  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.86 
 
 
525 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511177  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1224  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.61 
 
 
497 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3894  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  32.7 
 
 
470 aa  90.1  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2919  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.84 
 
 
478 aa  90.1  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2838  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.34 
 
 
497 aa  90.5  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.182548  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0810  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.88 
 
 
470 aa  90.5  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4692  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.52 
 
 
476 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0112  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.17 
 
 
484 aa  89.7  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00531501  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.45 
 
 
476 aa  89.7  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.48 
 
 
481 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0780  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.47 
 
 
475 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431367  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4450  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.65 
 
 
480 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3054  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.27 
 
 
505 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.746759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3068  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.27 
 
 
500 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0814  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.12 
 
 
490 aa  89.4  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0767  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.17 
 
 
475 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0276  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.81 
 
 
431 aa  89  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0465  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.8 
 
 
541 aa  89  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1262  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.33 
 
 
463 aa  89  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103305  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.17 
 
 
492 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2469  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.56 
 
 
475 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1759  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.04 
 
 
454 aa  88.2  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0257219  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1309  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.82 
 
 
499 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3356  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.65 
 
 
483 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617341  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1145  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.38 
 
 
476 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.45 
 
 
463 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3184  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  29.85 
 
 
476 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1921  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.93 
 
 
488 aa  87  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5903  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.63 
 
 
436 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1386  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.28 
 
 
435 aa  86.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0285292 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1444  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.84 
 
 
483 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1801  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  32.93 
 
 
488 aa  87  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>