280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0218 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0218  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  100 
 
 
303 aa  627  1e-179  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0245  deoxyribodipyrimidine photolyase  74.13 
 
 
298 aa  457  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.51093  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4249  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  61.45 
 
 
270 aa  341  8e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0011  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  61.45 
 
 
270 aa  340  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.161683  normal  0.149093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0940  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  53.41 
 
 
278 aa  326  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1867  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  59.93 
 
 
293 aa  323  2e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107933  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1589  DNA photolyase FAD-binding  56.71 
 
 
271 aa  265  8e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1249  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  49.05 
 
 
420 aa  189  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252669 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3370  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  39.9 
 
 
410 aa  119  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1389  putative deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.57 
 
 
405 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359515  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0617  deoxyribodipyrimidine photolyase-like protein  37.02 
 
 
396 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.07426  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2809  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  38.02 
 
 
403 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29652  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15221  DNA photolyase-like protein  31.5 
 
 
378 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.408051  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4047  Deoxyribodipyrimidine photolyase-like  32 
 
 
371 aa  95.5  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00445605  normal  0.106433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5309  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.31 
 
 
477 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61640  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.31 
 
 
481 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0940349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1613  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.74 
 
 
425 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0994  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.13 
 
 
462 aa  91.7  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15661  DNA photolyase-like protein  31.72 
 
 
371 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.675982  normal  0.652082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4658  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.71 
 
 
476 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0553081  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0728  putative DNA photolyase  32.2 
 
 
371 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.947552  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1458  deoxyribodipyrimidine photo-lyase family protein  29.47 
 
 
384 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.89887  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15471  DNA photolyase-like protein  26.75 
 
 
382 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.111669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  35.03 
 
 
472 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.95 
 
 
454 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15621  DNA photolyase-like protein  26.32 
 
 
384 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.299984  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00387  DNA photolyase (Eurofung)  33.16 
 
 
567 aa  86.7  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.892479  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5899  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.83 
 
 
519 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0769953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2178  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.83 
 
 
519 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240707  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  32.83 
 
 
468 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1252  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.91 
 
 
476 aa  87  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0460072  normal  0.903658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.13 
 
 
477 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2305  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.95 
 
 
467 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000471562  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3030  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.25 
 
 
451 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.334621  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4676  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.13 
 
 
500 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499221 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5488  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.89 
 
 
518 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.41 
 
 
492 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0151  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.68 
 
 
497 aa  83.2  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0953516  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0241  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.65 
 
 
492 aa  83.2  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2196  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.33 
 
 
519 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4704  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.98 
 
 
459 aa  82.8  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.940834 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4692  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.5 
 
 
476 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4270  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.22 
 
 
473 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397965  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.22 
 
 
486 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4736  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  32.74 
 
 
488 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0263  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.25 
 
 
490 aa  81.6  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0439  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  32.55 
 
 
435 aa  82  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.63 
 
 
469 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3349  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.89 
 
 
477 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355989  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1262  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.09 
 
 
463 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103305  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1134  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.97 
 
 
477 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1224  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.68 
 
 
497 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0998  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.84 
 
 
453 aa  80.5  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001252  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.82 
 
 
471 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553687  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0814  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.68 
 
 
490 aa  80.1  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03181  putative DNA photolyase  30.69 
 
 
478 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.07 
 
 
487 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2256  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.33 
 
 
479 aa  79.3  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.786952  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.12 
 
 
482 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1112  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.17 
 
 
487 aa  79.3  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196695  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3586  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.17 
 
 
487 aa  79.3  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1163  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.17 
 
 
487 aa  79.3  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0729  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.81 
 
 
483 aa  79  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0813  hypothetical protein  29.74 
 
 
486 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.63 
 
 
476 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.86 
 
 
479 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3356  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.83 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617341  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4450  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.71 
 
 
480 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2777  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.75 
 
 
469 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.36 
 
 
463 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0739  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.34 
 
 
480 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1302  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.43 
 
 
456 aa  78.2  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.674491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1380  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.95 
 
 
470 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866986  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2125  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.16 
 
 
479 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0780  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.26 
 
 
475 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431367  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.4 
 
 
484 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2595  cryptochrome, DASH family  27.99 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0775599  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0767  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.74 
 
 
475 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2095  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.78 
 
 
500 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2217  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.78 
 
 
525 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511177  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2714  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.1 
 
 
493 aa  77  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3589  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.18 
 
 
483 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008816  A9601_03081  putative DNA photolyase  28.16 
 
 
477 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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CP001800  Ssol_0276  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.66 
 
 
431 aa  77  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1444  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.51 
 
 
483 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.750444 
 
 
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NC_007575  Suden_1611  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.21 
 
 
445 aa  76.6  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1236  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.76 
 
 
493 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007963  Csal_0465  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.33 
 
 
473 aa  76.6  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1165  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.76 
 
 
493 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1152  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.95 
 
 
470 aa  76.6  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0172656  normal 
 
 
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NC_004347  SO_3384  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.25 
 
 
512 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.99 
 
 
482 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  31.36 
 
 
471 aa  76.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011313  VSAL_II0866  deoxyribodipyrimidine photo-lyase (photoreactivating enzyme)  27.8 
 
 
479 aa  76.3  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_2838  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.98 
 
 
497 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.182548  n/a   
 
 
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NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  31.36 
 
 
471 aa  76.3  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_1376  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.15 
 
 
492 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.73 
 
 
475 aa  75.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.237418 
 
 
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NC_009368  OSTLU_51395  predicted protein  32.34 
 
 
565 aa  75.9  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00141783 
 
 
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NC_009368  OSTLU_43003  predicted protein  32.34 
 
 
565 aa  75.9  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.832505  normal  0.0789751 
 
 
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