More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2834 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2834  response regulator receiver protein  100 
 
 
260 aa  512  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138077  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2193  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
716 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14825  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  30 
 
 
1158 aa  98.6  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 
2099 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 
1896 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 
812 aa  92  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 
2099 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
1303 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.31 
 
 
755 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  38.02 
 
 
137 aa  87.8  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
823 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4001  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  30.18 
 
 
229 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
1356 aa  86.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2174  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.69 
 
 
474 aa  85.9  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 
826 aa  85.5  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 
1127 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
977 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 
841 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 
2107 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  25.55 
 
 
1200 aa  84  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  30.48 
 
 
1695 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 
1098 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 
796 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.87 
 
 
1917 aa  82.4  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2262  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.68 
 
 
853 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 
1098 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 
1195 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0483  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
524 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
524 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 
1166 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 
925 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 
950 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 
697 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  26.69 
 
 
1179 aa  79.7  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1381  response regulator receiver protein  26.85 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.51 
 
 
1287 aa  79.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.05 
 
 
1203 aa  78.6  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.2 
 
 
1040 aa  78.2  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.23 
 
 
936 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 
944 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 
791 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.09 
 
 
858 aa  77.8  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
1158 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  28.24 
 
 
2035 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 
929 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3702  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.59 
 
 
863 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1943  histidine kinase  28.62 
 
 
647 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.539019  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
1362 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 
1936 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.09 
 
 
1271 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 
1857 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
798 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  33.33 
 
 
1937 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0481  response regulator receiver protein  28.46 
 
 
523 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1937 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0927  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 
704 aa  75.5  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0769186  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 
1240 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  29.41 
 
 
1361 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.96 
 
 
917 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
705 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  30 
 
 
792 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  28.18 
 
 
970 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.01 
 
 
876 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 
699 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.12 
 
 
1203 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0824  response regulator receiver protein  38.33 
 
 
122 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0263767  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3844  response regulator receiver domain-containing protein  38.4 
 
 
124 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.37 
 
 
1201 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
803 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3915  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.02 
 
 
839 aa  73.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.47 
 
 
1155 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  35.65 
 
 
121 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 
991 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2837  response regulator receiver protein  34.48 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000598352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.93 
 
 
1216 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.18 
 
 
1109 aa  72.4  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 
981 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.1 
 
 
1782 aa  72  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  25.43 
 
 
998 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 
1937 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0828  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
122 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000089442  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.48 
 
 
946 aa  72  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  31.82 
 
 
131 aa  72  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.66 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 
916 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.14 
 
 
1363 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 
1839 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3816  response regulator receiver protein  27.17 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0586034  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0508  response regulator receiver protein  27.17 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0266508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3760  response regulator receiver protein  27.17 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
1021 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  34.55 
 
 
133 aa  71.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  32.33 
 
 
919 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4754  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.55 
 
 
852 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16465  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  31.15 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.94 
 
 
1820 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  36.44 
 
 
143 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.44 
 
 
1189 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0549  response regulator receiver protein  25.79 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.36 
 
 
1267 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>