More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2412 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2412  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 273 aa  553  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  32.98 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  31.83 
 
 		 265 aa  102  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  30.96 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  30.96 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  33.33 
 
 		 265 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  39.04 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  41.38 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  28.37 
 
 		 268 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  43.54 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  31.32 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  28.25 
 
 		 252 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  29.26 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  32.09 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  30.5 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  29.1 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  35.87 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  35.64 
 
 		 259 aa  85.5  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  33.82 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0130  stationary-phase survival protein SurE  34.42 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  33.21 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  32.48 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  31.72 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  33.46 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  33.82 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  34.65 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  40.54 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  34.65 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  32.12 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19351  stationary phase survival protein SurE  37.41 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.692347 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  41.5 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  31.85 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04967  acid phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10220)  32.95 
 
 		 757 aa  80.9  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.994495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  36.73 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  36.14 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  29.59 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  35.62 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  36.73 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  35.62 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  36.32 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  37.32 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2355  stationary-phase survival protein SurE  29.6 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0835343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2731  stationary phase survival protein SurE  36.79 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  36.05 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1369  stationary-phase survival protein SurE  32.48 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  28.78 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  36.05 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1004  stationary phase survival protein SurE  27.14 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4055  stationary phase survival protein SurE  30 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  39.31 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  32.34 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2519  stationary phase survival protein SurE  31.48 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123988  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1252  stationary phase survival protein SurE  31.11 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507055 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  28.47 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  31.99 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  29.56 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  32.47 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  34.69 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  38.1 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  28.84 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1536  stationary phase survival protein SurE  39.46 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  42 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  29.48 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0271  stationary-phase survival protein SurE  29.7 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.848297  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  32.56 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  37.93 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2739  stationary phase survival protein SurE  34.06 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  33.46 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  29.45 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_703  stationary-phase survival protein  37.91 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000177307  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1981  5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase / exopolyphosphatase  33.11 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  31.43 
 
 		 248 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  37.24 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  34.93 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  36.81 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  37.93 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2784  stationary phase survival protein SurE  33.7 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  29.32 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  29.59 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  31.34 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  30.74 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  30 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  33.65 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3061  stationary phase survival protein SurE  30.09 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.464375 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  27.57 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  33.67 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  33.33 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0491  stationary phase survival protein SurE  27.37 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0551134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1620  stationary phase survival protein SurE  29.63 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1313  stationary phase survival protein SurE  32.26 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  40.85 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1643  stationary-phase survival protein SurE  38.62 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  32.84 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  32.34 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  32.16 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0305  stationary phase survival protein SurE  33.03 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  30.5 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  37.24 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  37.24 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  29.52 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>