More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2355 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2355  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 		 263 aa  533  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0835343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0271  stationary-phase survival protein SurE  70.57 
 
 		 266 aa  370  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.848297  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1422  stationary-phase survival protein SurE  62.31 
 
 		 268 aa  326  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2394  stationary-phase survival protein SurE  60.15 
 
 		 274 aa  314  9.999999999999999e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1292  Survival protein SurE  57.63 
 
 		 271 aa  286  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1478  stationary-phase survival protein SurE  45.68 
 
 		 278 aa  229  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2324  stationary-phase survival protein SurE  41.29 
 
 		 296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.832903 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  40.98 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  39.47 
 
 		 250 aa  128  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  37.08 
 
 		 263 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  36.65 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  36.47 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  40.41 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  34.25 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  37.55 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  33.07 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  34.82 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0723  stationary phase survival protein SurE  36.55 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000069288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  38.31 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  35.8 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0797  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000405923  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  30.36 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  33.74 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  33.33 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_703  stationary-phase survival protein  35.74 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000177307  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  33.2 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  35.55 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  36.07 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  36.53 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  34.05 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  33.09 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1075  stationary phase survival protein SurE  33.2 
 
 		 260 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1922  stationary phase survival protein SurE  35.92 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170775 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  34.56 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2685  stationary phase survival protein SurE  40 
 
 		 248 aa  105  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  32.37 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  29.26 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  35.29 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  35.59 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  33.46 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  34.94 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  38.4 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0660  stationary-phase survival protein SurE  32.32 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1555  stationary phase survival protein SurE  39.59 
 
 		 248 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  43.41 
 
 		 252 aa  102  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  33.07 
 
 		 252 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  35.06 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  33.09 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  33.73 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  33.73 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  34.85 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  32.97 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  34.01 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  34.01 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  34.14 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0926  stationary phase survival protein SurE  35.09 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  34.01 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1369  stationary-phase survival protein SurE  35.46 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  34.06 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  32.82 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  47.97 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  33.06 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  35.93 
 
 		 251 aa  99.4  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  35.89 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  45.74 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 		 258 aa  99.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5029  stationary phase survival protein SurE  33.21 
 
 		 289 aa  99  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  33.58 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  33.7 
 
 		 259 aa  99  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  46.46 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  31.2 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  30.97 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  35.55 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1068  stationary phase survival protein SurE  31.66 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2782  stationary phase survival protein SurE  32.58 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  32.55 
 
 		 280 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  34.65 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  34.35 
 
 		 249 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  35 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  31.45 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  35.98 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  33.6 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  33.71 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  32.96 
 
 		 245 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  34.1 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  29.51 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38710  stationary phase survival protein SurE  35.63 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2311  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  35.18 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31938  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  32.71 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  29.51 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  32.7 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  32.71 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  36.64 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0400  stationary-phase survival protein SurE  29.88 
 
 		 270 aa  95.9  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.207609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0130  stationary-phase survival protein SurE  33.83 
 
 		 257 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  31.18 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  31.97 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  35.55 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>