More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2324 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2324  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 
296 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.832903 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2355  stationary-phase survival protein SurE  41.24 
 
 
263 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0835343  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1478  stationary-phase survival protein SurE  39.79 
 
 
278 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0271  stationary-phase survival protein SurE  41.67 
 
 
266 aa  161  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.848297  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1422  stationary-phase survival protein SurE  41.01 
 
 
268 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2394  stationary-phase survival protein SurE  39.31 
 
 
274 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1292  Survival protein SurE  41.76 
 
 
271 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  37.36 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  40.93 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  36 
 
 
260 aa  113  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1304  stationary-phase survival protein SurE  36.63 
 
 
248 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  37.13 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  37.26 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  32.27 
 
 
255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  34.8 
 
 
251 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  35.64 
 
 
263 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  36.47 
 
 
248 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  37.98 
 
 
264 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  36.79 
 
 
264 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  43.55 
 
 
263 aa  106  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1160  stationary phase survival protein SurE  34.33 
 
 
280 aa  106  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.141481  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  38.8 
 
 
247 aa  106  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  36.68 
 
 
247 aa  105  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1369  stationary-phase survival protein SurE  34.55 
 
 
272 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  34.58 
 
 
257 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  32.98 
 
 
261 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  34.21 
 
 
248 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  35.9 
 
 
249 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1080  stationary phase survival protein SurE  34.21 
 
 
260 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200755  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  35.96 
 
 
247 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  36.43 
 
 
250 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  41.34 
 
 
259 aa  102  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  30.11 
 
 
252 aa  102  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  32.37 
 
 
267 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  42.22 
 
 
249 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  31.93 
 
 
259 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  36.23 
 
 
252 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1075  stationary phase survival protein SurE  32.49 
 
 
260 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  38.65 
 
 
262 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  38.65 
 
 
262 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3061  stationary phase survival protein SurE  39.89 
 
 
261 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.464375 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  47.33 
 
 
258 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  35.25 
 
 
258 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  34.56 
 
 
259 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  33.92 
 
 
255 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  41.71 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  38.89 
 
 
263 aa  99.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  35.38 
 
 
270 aa  99.4  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  35.02 
 
 
259 aa  99  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  47.66 
 
 
253 aa  99  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  38.96 
 
 
254 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  43.82 
 
 
251 aa  98.6  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2579  stationary phase survival protein SurE  41.11 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299387  hitchhiker  0.00294164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  34.42 
 
 
259 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  39.01 
 
 
252 aa  98.6  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  31.71 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1650  stationary phase survival protein SurE  38.12 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000306201  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  42.61 
 
 
252 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  33.92 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  33.92 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  33.92 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  34.18 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  33.92 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  33.92 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  41.08 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  33.92 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0660  stationary-phase survival protein SurE  41.34 
 
 
269 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272098  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  41.34 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0325  stationary phase survival protein SurE  36.26 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  33.92 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  33.92 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  33.47 
 
 
269 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  38.98 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  34.18 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  38.12 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  35.07 
 
 
258 aa  96.7  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  35.99 
 
 
255 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3052  stationary phase survival protein SurE  35.99 
 
 
255 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920376  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  41.81 
 
 
245 aa  96.3  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  51.16 
 
 
252 aa  95.9  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  39.33 
 
 
252 aa  95.9  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  33.45 
 
 
259 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  33.45 
 
 
259 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  42.54 
 
 
257 aa  95.9  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  43.58 
 
 
247 aa  95.9  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  33.45 
 
 
259 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  50.77 
 
 
262 aa  95.5  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  33.82 
 
 
260 aa  95.9  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  37.97 
 
 
254 aa  95.9  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  35.99 
 
 
255 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  39.55 
 
 
251 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  34.04 
 
 
249 aa  95.1  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5029  stationary phase survival protein SurE  33.09 
 
 
289 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  34.33 
 
 
259 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  39.33 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1536  stationary phase survival protein SurE  32.12 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  34.7 
 
 
258 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  32.25 
 
 
265 aa  94  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  35.64 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>