More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1422 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1422  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 
268 aa  537  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2394  stationary-phase survival protein SurE  72.86 
 
 
274 aa  382  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2355  stationary-phase survival protein SurE  62.31 
 
 
263 aa  326  2.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0835343  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0271  stationary-phase survival protein SurE  63.06 
 
 
266 aa  310  1e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.848297  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1292  Survival protein SurE  58.08 
 
 
271 aa  279  3e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1478  stationary-phase survival protein SurE  49.03 
 
 
278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2324  stationary-phase survival protein SurE  40.52 
 
 
296 aa  143  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.832903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  35.47 
 
 
267 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1369  stationary-phase survival protein SurE  40.45 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  33.46 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  38.59 
 
 
247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0570  stationary phase survival protein SurE  35.02 
 
 
279 aa  125  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0233942  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  37.04 
 
 
263 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  36.03 
 
 
264 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  38.1 
 
 
264 aa  122  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  35.94 
 
 
253 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  35.94 
 
 
265 aa  122  7e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  36.03 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  36.19 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0582  stationary phase survival protein SurE  36.33 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0371986  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0919  stationary phase survival protein SurE  36.07 
 
 
260 aa  119  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00356117  hitchhiker  0.000000000638596 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  36.8 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  36.63 
 
 
250 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  35.51 
 
 
263 aa  115  6e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  35.69 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  33.83 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  33.2 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  37.12 
 
 
257 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  36.5 
 
 
250 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  34.69 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  36.33 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0723  stationary phase survival protein SurE  34.19 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000069288  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0797  stationary phase survival protein SurE  34.68 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000405923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  37.3 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  37.2 
 
 
250 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  34.27 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  34.56 
 
 
255 aa  109  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  35.74 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2545  stationary phase survival protein SurE  34.77 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  34.69 
 
 
263 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  36.76 
 
 
252 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0660  stationary-phase survival protein SurE  32.69 
 
 
269 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272098  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1205  stationary phase survival protein SurE  34.38 
 
 
261 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  32.2 
 
 
258 aa  106  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  32.67 
 
 
258 aa  106  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2311  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  38.1 
 
 
279 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31938  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  35.71 
 
 
252 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  35.27 
 
 
247 aa  106  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  34.88 
 
 
248 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  35.42 
 
 
269 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1299  stationary-phase survival protein SurE  35.25 
 
 
261 aa  105  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108433  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_703  stationary-phase survival protein  34.27 
 
 
265 aa  105  9e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000177307  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  33.6 
 
 
248 aa  105  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  34.02 
 
 
246 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  36 
 
 
254 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  34.78 
 
 
252 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  34.29 
 
 
251 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  34.22 
 
 
249 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  34.91 
 
 
257 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  28.91 
 
 
252 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  34.78 
 
 
252 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1922  stationary phase survival protein SurE  34.57 
 
 
253 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170775 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  32.86 
 
 
277 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0876  stationary phase survival protein SurE  34.69 
 
 
225 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.280564  hitchhiker  0.0000231421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  34.4 
 
 
251 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1075  stationary phase survival protein SurE  30.95 
 
 
260 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1977  stationary phase survival protein SurE  33.07 
 
 
261 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.135729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  33.88 
 
 
251 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  33.98 
 
 
249 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  34.78 
 
 
252 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  34.52 
 
 
259 aa  102  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  34 
 
 
259 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  34.12 
 
 
256 aa  102  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 
260 aa  102  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  32.69 
 
 
249 aa  102  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0285  5'-nucleotidase / exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase  30.86 
 
 
256 aa  101  1e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.443124  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  39.02 
 
 
263 aa  101  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2136  stationary phase survival protein SurE  34.38 
 
 
261 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.57174  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  35.2 
 
 
259 aa  101  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  33.33 
 
 
259 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  33.61 
 
 
245 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  34.11 
 
 
260 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  33.2 
 
 
269 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  35.22 
 
 
251 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1080  stationary phase survival protein SurE  32.41 
 
 
260 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200755  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  35.2 
 
 
250 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1160  stationary phase survival protein SurE  32.41 
 
 
280 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.141481  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  32.95 
 
 
247 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  35.71 
 
 
259 aa  100  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5029  stationary phase survival protein SurE  32.41 
 
 
289 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  32.23 
 
 
249 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  37.6 
 
 
255 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  33.47 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1414  stationary phase survival protein SurE  32.03 
 
 
263 aa  99.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  30.92 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  34.01 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38710  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1536  stationary phase survival protein SurE  32.71 
 
 
264 aa  99.8  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  35.68 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  32.32 
 
 
249 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>