More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0876 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0876  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
225 aa  460  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.280564  hitchhiker  0.0000231421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3836  stationary phase survival protein SurE  60.71 
 
 
226 aa  291  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2176  stationary phase survival protein SurE  61.09 
 
 
225 aa  276  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2128  stationary phase survival protein SurE  61.09 
 
 
225 aa  276  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2384  stationary phase survival protein SurE  54.7 
 
 
252 aa  268  7e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.811151 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1917  stationary phase survival protein SurE  58.59 
 
 
227 aa  267  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.554559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1774  stationary phase survival protein SurE  47.11 
 
 
232 aa  222  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00468651  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  34.75 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  34.75 
 
 
257 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  43.93 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  36.44 
 
 
256 aa  124  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  37.87 
 
 
252 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  37.24 
 
 
269 aa  121  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  38.1 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  38.1 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1369  stationary-phase survival protein SurE  35.2 
 
 
272 aa  118  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  39.88 
 
 
273 aa  118  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  41.57 
 
 
245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  40.49 
 
 
249 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  37.68 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  40.49 
 
 
249 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  40.49 
 
 
249 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 
249 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  35.09 
 
 
259 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  40.49 
 
 
249 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  39.16 
 
 
248 aa  115  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  40.11 
 
 
263 aa  115  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1792  stationary phase survival protein SurE  34.3 
 
 
255 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637377  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  39.26 
 
 
249 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  39.26 
 
 
249 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 
249 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  34.85 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  40.49 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  39.88 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  44.31 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  34.31 
 
 
263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  35.32 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  40.49 
 
 
273 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  39.26 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  32.63 
 
 
255 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  37.02 
 
 
261 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  35.02 
 
 
254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  35.02 
 
 
254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  35.02 
 
 
254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  32.62 
 
 
266 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  33.76 
 
 
252 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1791  stationary phase survival protein SurE  39.01 
 
 
260 aa  111  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368388  normal  0.0362301 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  40.48 
 
 
258 aa  111  8.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  35.12 
 
 
254 aa  111  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  32.19 
 
 
252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  33.61 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  40.24 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  39.26 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  33.47 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  37.06 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1536  stationary phase survival protein SurE  39.88 
 
 
264 aa  109  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1168  stationary phase survival protein SurE  33.47 
 
 
256 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.318456  normal  0.0991312 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 
257 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  33.5 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  33.88 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  39.26 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  39.26 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  32.92 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  39.26 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  41.38 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  39.88 
 
 
259 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  41.57 
 
 
253 aa  108  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  38.65 
 
 
249 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  40.36 
 
 
251 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  35.74 
 
 
257 aa  108  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  35.12 
 
 
270 aa  108  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  38.65 
 
 
249 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  36.9 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  38.79 
 
 
263 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  35.71 
 
 
262 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  39.63 
 
 
258 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0723  stationary phase survival protein SurE  39.77 
 
 
265 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000069288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  37.95 
 
 
252 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  39.63 
 
 
258 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  38.55 
 
 
259 aa  106  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1068  stationary phase survival protein SurE  37.16 
 
 
263 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  40.36 
 
 
257 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  33.47 
 
 
253 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  42.17 
 
 
248 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  39.16 
 
 
252 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_703  stationary-phase survival protein  39.18 
 
 
265 aa  105  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000177307  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  39.16 
 
 
252 aa  105  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0130  stationary-phase survival protein SurE  35.42 
 
 
257 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  48.46 
 
 
257 aa  104  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1203  stationary-phase survival protein SurE  37.04 
 
 
244 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.975594  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  48.82 
 
 
250 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  37.13 
 
 
259 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  36.36 
 
 
258 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  36.26 
 
 
246 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1422  stationary-phase survival protein SurE  34.69 
 
 
268 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  38.89 
 
 
254 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  37.42 
 
 
249 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  36.57 
 
 
253 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  32.92 
 
 
255 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.570918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>