More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1917 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1917  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.554559 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2176  stationary phase survival protein SurE  71.81 
 
 
225 aa  346  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2128  stationary phase survival protein SurE  71.81 
 
 
225 aa  346  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3836  stationary phase survival protein SurE  62.56 
 
 
226 aa  302  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0876  stationary phase survival protein SurE  58.59 
 
 
225 aa  267  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.280564  hitchhiker  0.0000231421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2384  stationary phase survival protein SurE  54.27 
 
 
252 aa  266  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.811151 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1774  stationary phase survival protein SurE  48.25 
 
 
232 aa  219  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00468651  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  35.02 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  36.48 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  39.31 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  35.29 
 
 
260 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  36.48 
 
 
251 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  38.69 
 
 
252 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  34.89 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
257 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  34.89 
 
 
248 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1536  stationary phase survival protein SurE  35.2 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0723  stationary phase survival protein SurE  38.71 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000069288  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  34.6 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  36.86 
 
 
262 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  32.49 
 
 
257 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  39.76 
 
 
253 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  37.95 
 
 
248 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  40.85 
 
 
247 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_703  stationary-phase survival protein  39.25 
 
 
265 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000177307  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  32.26 
 
 
270 aa  115  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2311  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  40.45 
 
 
279 aa  114  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31938  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  33.19 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  35.29 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  36.32 
 
 
258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1643  stationary-phase survival protein SurE  34.75 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  36.32 
 
 
258 aa  113  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  34.33 
 
 
251 aa  113  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  40.59 
 
 
251 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  33.19 
 
 
273 aa  112  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  37.65 
 
 
250 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3114  stationary phase survival protein SurE  32.77 
 
 
269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.120886 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  33.06 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  38.83 
 
 
250 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  34.7 
 
 
259 aa  112  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  37.95 
 
 
245 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  35.37 
 
 
259 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  30.95 
 
 
258 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  40.48 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  32.92 
 
 
277 aa  111  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4055  stationary phase survival protein SurE  34.62 
 
 
249 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1620  stationary phase survival protein SurE  33.05 
 
 
249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  35.54 
 
 
248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  39.05 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  36.75 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  33.76 
 
 
249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1369  stationary-phase survival protein SurE  33.2 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  34.05 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  33.05 
 
 
249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  34.9 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2701  stationary-phase survival protein SurE  33.33 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  32.67 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  33.76 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  31.47 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  33.48 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  33.05 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  33.54 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  31.47 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  31.47 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  32.33 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1210  stationary phase survival protein SurE  33.9 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.8797  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  33.82 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  33.82 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  32.22 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  31.47 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0959  stationary phase survival protein SurE  33.47 
 
 
252 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  34.93 
 
 
270 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4157  stationary phase survival protein SurE  33.05 
 
 
249 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0755063 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  31.93 
 
 
252 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  33.89 
 
 
251 aa  109  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  37.93 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  36.14 
 
 
249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  31.93 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  36.14 
 
 
249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  37.7 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  34.31 
 
 
249 aa  108  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  31.51 
 
 
253 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1834  stationary phase survival protein SurE  33.05 
 
 
252 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655214  normal  0.138522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  30.67 
 
 
253 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  33.33 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  32.64 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  39.88 
 
 
293 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  45.74 
 
 
257 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  31.91 
 
 
259 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  31.67 
 
 
269 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  36.36 
 
 
263 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  37.2 
 
 
247 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  32.37 
 
 
260 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4019  5'-nucleotidase  30.47 
 
 
259 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  35.5 
 
 
248 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0325  stationary phase survival protein SurE  30.96 
 
 
256 aa  107  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  35.03 
 
 
258 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2353  stationary phase survival protein SurE  32.77 
 
 
252 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17013  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  33.54 
 
 
259 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>