More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1774 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1774  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 
232 aa  484  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00468651  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3836  stationary phase survival protein SurE  46.49 
 
 
226 aa  231  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2128  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 
225 aa  231  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2176  stationary phase survival protein SurE  50 
 
 
225 aa  231  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0876  stationary phase survival protein SurE  47.11 
 
 
225 aa  222  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.280564  hitchhiker  0.0000231421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2384  stationary phase survival protein SurE  45.49 
 
 
252 aa  221  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.811151 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1917  stationary phase survival protein SurE  48.25 
 
 
227 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.554559 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4752  stationary phase survival protein SurE  33.47 
 
 
254 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  35.44 
 
 
252 aa  115  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38710  stationary phase survival protein SurE  36.05 
 
 
249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  36.63 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7398  stationary phase survival protein SurE  32.63 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.119815  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6576  stationary phase survival protein SurE  32.63 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  36.63 
 
 
258 aa  114  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  35.47 
 
 
265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1369  stationary-phase survival protein SurE  33.33 
 
 
272 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  31.51 
 
 
260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2281  stationary phase survival protein SurE  33.9 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  34.43 
 
 
261 aa  108  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1295  stationary phase survival protein SurE  37.95 
 
 
249 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0660  stationary-phase survival protein SurE  39.74 
 
 
269 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272098  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4603  stationary phase survival protein SurE  31.78 
 
 
254 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.137607  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5346  stationary-phase survival protein SurE  29.61 
 
 
259 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4233  stationary phase survival protein SurE  31.78 
 
 
254 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  32.07 
 
 
277 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  32.33 
 
 
248 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  35.05 
 
 
247 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3122  stationary phase survival protein SurE  36.09 
 
 
249 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3131  stationary phase survival protein SurE  36.09 
 
 
249 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.973378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3274  stationary phase survival protein SurE  36.09 
 
 
249 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  31.06 
 
 
259 aa  106  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1242  stationary phase survival protein SurE  36.09 
 
 
249 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0690072  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  35.04 
 
 
257 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1414  stationary phase survival protein SurE  33.77 
 
 
263 aa  105  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0638  stationary phase survival protein SurE  34.68 
 
 
254 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.086039  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  37.64 
 
 
259 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0090  stationary phase survival protein SurE  32.47 
 
 
259 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  34.48 
 
 
269 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  35.37 
 
 
259 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2118  stationary phase survival protein SurE  30.51 
 
 
250 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.092559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1204  stationary phase survival protein SurE  32.07 
 
 
251 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.952708  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  38.01 
 
 
253 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  32.46 
 
 
259 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  39.64 
 
 
252 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  35.2 
 
 
252 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  35.37 
 
 
273 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1797  stationary phase survival protein SurE  34.35 
 
 
252 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3345  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 
249 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.000000220654 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  37.23 
 
 
259 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  37.22 
 
 
265 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2902  exopolyphosphatase / 5'-nucleotidase / 3'-nucleotidase  34.15 
 
 
259 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  34.78 
 
 
245 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
249 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  35.71 
 
 
257 aa  102  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4412  stationary phase survival protein SurE  30.86 
 
 
255 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5232  stationary-phase survival protein SurE  34.15 
 
 
259 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159736  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1689  stationary phase survival protein SurE  35.43 
 
 
257 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  31.65 
 
 
250 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  31.28 
 
 
251 aa  101  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6551  stationary-phase survival protein SurE  35.59 
 
 
261 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  33.19 
 
 
250 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1160  stationary phase survival protein SurE  35.53 
 
 
280 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.141481  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1080  stationary phase survival protein SurE  35.53 
 
 
260 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.200755  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  31.2 
 
 
253 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  33.85 
 
 
249 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  35.71 
 
 
262 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1775  stationary phase survival protein SurE  29.75 
 
 
255 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.100657  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  35.37 
 
 
250 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1575  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 
258 aa  100  2e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0791  acid phosphatase SurE  34.78 
 
 
256 aa  100  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1140  stationary phase survival protein SurE  31.65 
 
 
251 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  36.05 
 
 
264 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  37.57 
 
 
255 aa  99.8  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1491  stationary phase survival protein SurE  35.06 
 
 
257 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3182  stationary phase survival protein SurE  28.51 
 
 
255 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00064079  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  34.91 
 
 
249 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  35.45 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  30.47 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  34.68 
 
 
248 aa  99.4  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1174  stationary phase survival protein SurE  32.05 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.912952  normal  0.346384 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1203  stationary-phase survival protein SurE  39.44 
 
 
244 aa  99.8  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.975594  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  32.33 
 
 
259 aa  99  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1048  stationary phase survival protein SurE  31.22 
 
 
251 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.929954  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1670  stationary phase survival protein SurE  35.47 
 
 
258 aa  99  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.80003  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  31.44 
 
 
249 aa  99.4  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3740  stationary-phase survival protein SurE  33.93 
 
 
280 aa  99.4  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.18688  normal  0.856186 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  31.65 
 
 
252 aa  99  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4813  stationary-phase survival protein SurE  34.15 
 
 
259 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  34.32 
 
 
249 aa  99  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  34.32 
 
 
249 aa  99  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  36.26 
 
 
264 aa  98.6  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3354  stationary-phase survival protein SurE  34.15 
 
 
259 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4162  stationary-phase survival protein SurE  34.15 
 
 
259 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.293116  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1620  stationary phase survival protein SurE  31.62 
 
 
249 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  38.1 
 
 
258 aa  98.2  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  35.71 
 
 
270 aa  98.6  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4055  stationary phase survival protein SurE  32.48 
 
 
249 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243383 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  34.32 
 
 
249 aa  98.2  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2635  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  36.46 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>